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Enregistrement W4205329448 · doi:10.3390/vaccines10010124

Immunoprofiling Identifies Functional B and T Cell Subsets Induced by an Attenuated Whole Parasite Malaria Vaccine as Correlates of Sterile Immunity

2022· article· en· W4205329448 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueVaccines · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemMalaria vaccineMalariaT cellImmunizationVaccine efficacyImmunity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immune correlates of protection remain elusive for most vaccines. An identified immune correlate would accelerate the down-selection of vaccine formulations by reducing the need for human pathogen challenge studies that are currently required to determine vaccine efficacy. Immunization via mosquito-delivered, radiation-attenuated P. falciparum sporozoites (IMRAS) is a well-established model for efficacious malaria vaccines, inducing greater than 90% sterile immunity. The current immunoprofiling study utilized samples from a clinical trial in which vaccine dosing was adjusted to achieve only 50% protection, thus enabling a comparison between protective and non-protective immune signatures. In-depth immunoprofiling was conducted by assessing a wide range of antigen-specific serological and cellular parameters and applying our newly developed computational tools, including machine learning. The computational component of the study pinpointed previously un-identified cellular T cell subsets (namely, TNFα-secreting CD8+CXCR3−CCR6− T cells, IFNγ-secreting CD8+CCR6+ T cells and TNFα/FNγ-secreting CD4+CXCR3−CCR6− T cells) and B cell subsets (i.e., CD19+CD24hiCD38hiCD69+ transitional B cells) as important factors predictive of protection (92% accuracy). Our study emphasizes the need for in-depth immunoprofiling and subsequent data integration with computational tools to identify immune correlates of protection. The described process of computational data analysis is applicable to other disease and vaccine models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,214
Score d'incertitude au seuil0,843

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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