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Enregistrement W4205488419 · doi:10.3390/cancers14020353

CDK5RAP3, a New BRCA2 Partner That Regulates DNA Repair, Is Associated with Breast Cancer Survival

2022· article· en· W4205488419 sur OpenAlexafffund
Jordi Minguillón, Marı́a José Ramı́rez, Llorenç Rovirosa, Pilar Bustamante‐Madrid, Cristina Camps-Fajol, Gorka Ruíz de Garibay, Hermela Shimelis, Helena Montanuy, Roser Pujol, Gonzalo Hernández, Massimo Bogliolo, Pau Castillo Bosch, Penny Soucy, Griselda Martrat, Antonio Gómez, Daniel Cuadras, María J. García, Javier Machín Gayarre, Conxi Lázaro, Javier Benı́tez, Fergus J. Couch, Miguel Ángel Pujana, Jordi Surrallés

Notice bibliographique

RevueCancers · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteInstituto de Salud Carlos IIICanadian Institutes of Health ResearchMinistero dello Sviluppo EconomicoInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsCancer Research UKGovernment of CanadaCentres de Recerca de CatalunyaFondation du cancer du sein du QuébecMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesEuropean CommissionBreast Cancer Research FoundationFanconi Anemia Research FundGeneralitat de CatalunyaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationAgencia Estatal de InvestigaciónGenome CanadaNational Institutes of HealthOvarian Cancer Research Fund
Mots-clésGenome instabilityHomologous recombinationDNA repairBreast cancerDNA damageBRCA2 ProteinBiologyCancer researchOvarian cancerDNAGeneticsMutationCancerGermline mutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BRCA2 is essential for homologous recombination DNA repair. BRCA2 mutations lead to genome instability and increased risk of breast and ovarian cancer. Similarly, mutations in BRCA2-interacting proteins are also known to modulate sensitivity to DNA damage agents and are established cancer risk factors. Here we identify the tumor suppressor CDK5RAP3 as a novel BRCA2 helical domain-interacting protein. CDK5RAP3 depletion induced DNA damage resistance, homologous recombination and single-strand annealing upregulation, and reduced spontaneous and DNA damage-induced genomic instability, suggesting that CDK5RAP3 negatively regulates double-strand break repair in the S-phase. Consistent with this cellular phenotype, analysis of transcriptomic data revealed an association between low CDK5RAP3 tumor expression and poor survival of breast cancer patients. Finally, we identified common genetic variations in the CDK5RAP3 locus as potentially associated with breast and ovarian cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Our results uncover CDK5RAP3 as a critical player in DNA repair and breast cancer outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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