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Enregistrement W4205541410 · doi:10.1109/tim.2021.3135531

Novel Field-Effect Transistor Sensor for DNA Storage Monitoring

2021· article· en· W4205541410 sur OpenAlexafffund
Abbas Panahi, Morteza Ghafar-Zadeh, Anthony Scimè, Sebastian Magierowski, Ebrahim Ghafar‐Zadeh

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Instrumentation and Measurement · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésJFETDNAComputer scienceAlgorithmTransistorElectrical engineeringBiologyEngineeringField-effect transistorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article presents a novel open gate junction field-effect transistor (OG-JFET)-based sensor that can be used for various life science applications including deoxyribonucleic acid (DNA) storage monitoring. We put forward the design, modeling, implementation, and characterization of OG-JFET sensor using a foundry process through CMC Microsystems. We also demonstrate and discuss the functionality and applicability of the proposed sensor for monitoring DNA samples suitable for DNA storage applications. Synthetic storage has emerged as an intriguing data storage solution with high density and long-term preservation potential. Most common modalities include the conversion of digital data into synthesized nucleotides, the physical storage of DNA materials, and reading out the data via sequencing and other computational processes. Among these, this article tackles the challenge of physical storage monitoring of DNA materials by developing a sensor for measurement of DNA samples in dry conditions. The proposed sensor reveals a linear response of sensor toward DNA concentration in ultra-pure water. Across a 0.7 mm <sup xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">2</sup> sensing area, a DNA mass concentration from approximately 100–400 ng/ <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"> <tex-math notation="LaTeX">$\mu \text{L}$ </tex-math></inline-formula> has been detected using OG-JFET demonstrating a sensitivity of 30 <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"> <tex-math notation="LaTeX">$\mu \text{A}$ </tex-math></inline-formula> /(ng/ <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"> <tex-math notation="LaTeX">$\mu \text{L}$ </tex-math></inline-formula> ). These performance quantities imply a promising role for OG-JFETs in emerging biotechnology applications including DNA storage monitoring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,647
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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