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Enregistrement W4205551016 · doi:10.1089/fpd.2021.0034

Incidence, Demographic, and Seasonal Risk Factors of Infections Caused by Five Major Enteric Pathogens, Ontario, Canada, 2010–2017

2022· article· en· W4205551016 sur OpenAlexaffabout
Patience John, Csaba Varga, Martin Cooke, Shannon E. Majowicz

Notice bibliographique

RevueFoodborne Pathogens and Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacterSalmonellaListeria monocytogenesIncidence (geometry)OutbreakBiologyListeriaYersiniaVTECPopulationVeterinary medicineEpidemiologyMicrobiologyMedicineEnvironmental healthInternal medicineVirologyEscherichia coliBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Canada, enteric infections cause significant health and economic burden. We evaluated the individual characteristics of laboratory-confirmed cases of Campylobacter spp. (n = 28,728), non-typhoidal Salmonella spp. (n = 22,640), Yersinia spp. (n = 1674), Verotoxin-producing Escherichia coli (VTEC; n = 1340), and Listeria monocytogenes (n = 471), reported between 2010 and 2017 inclusive, in Ontario, Canada (population ∼13,500,000). We calculated overall and pathogen-specific annual and mean incidence rates (IRs) for Ontario. We used multivariable Poisson and negative binomial regression models to estimate incidence rate ratios (IRRs) for years, seasons, age groups, and sexes, and we included two-way age and sex interaction terms in the models. Campylobacter and Salmonella infections had the highest IRs whereas Listeria infections had the lowest IRs. None of the infections showed long-term trends over the 8-year study period; however, rates of all five infections were elevated in the summer. More Salmonella, VTEC, and Listeria infections were linked to disease outbreaks than were Campylobacter and Yersinia infections. Overall, mean IRs of Campylobacter, Salmonella, Yersinia, and VTEC infections were highest in children 0–4 years old, whereas Listeria IRs peaked in adults 60 years and older. Higher mean IRs of Campylobacter were observed in males. No other differences by sex were statistically significant. The same mean rate was observed in both sexes for Listeria. Adjusting for all other factors, significant age- and sex-specific differences in IRs were observed in Campylobacter, Salmonella, and VTEC infection rates. No significant interactions of age and sex were found for Yersinia and Listeria infections. Future research should focus on the pathogen-specific socioeconomic, environmental, or agricultural risk factors that might be responsible for these infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,253

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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