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Enregistrement W4205659437 · doi:10.1186/s40168-021-01185-9

Immune milieu and microbiome of the distal urethra in Ugandan men: impact of penile circumcision and implications for HIV susceptibility

2022· article· en· W4205659437 sur OpenAlexafffund
Ronald M. Galiwango, Daniel E. Park, Sanja Huibner, Abigail Onos, Maliha Aziz, Kelsey Roach, Aggrey Anok, James Nnamutete, Yahaya Isabirye, John Bosco Wasswa, Deo Male, Godfrey Kigozi, Aaron A.R. Tobian, Jessica L. Prodger, Cindy M. Liu, Rupert Kaul

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenital Health and Disease
Établissements canadiensWestern UniversityCanada Research ChairsUniversity of TorontoUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesFogarty International CenterNational Institutes of HealthUniversity of TorontoNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesOntario HIV Treatment Network
Mots-clésUrethraBiologyImmune systemSex organInternal medicineImmunologyUrologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Coronal sulcus (CS) anaerobe abundance and IL-8 levels are linked to HIV acquisition, and are dramatically reduced after penile circumcision (PC). The distal urethra may be the site of some HIV acquisition before PC, and presumably most acquisition post PC. We describe the immune milieu and microbiome of the distal urethra in uncircumcised Ugandan men, and define the impact of PC. Participants consisted of HIV-negative, genital symptom-free adult Ugandan men undergoing PC (n = 51). Urethral and coronal sulcus swabs were collected at baseline and at 6- and 12-months post-PC. Soluble immune factors were quantified by multiplex ELISA, and bacterial abundance assessed by 16S rRNA qPCR and sequencing. RESULTS: At baseline, the urethra was enriched compared to the CS for most cytokines (including IL-8 and MIP-1β) and soluble E-cadherin (sE-cadherin, an epithelial disruption marker), although CS levels of IL-1α and IL-1β were higher. Baseline total bacterial abundance was ≥ 20-fold higher in the CS than the urethra (median 27,100 vs. 1200 gene copies/swab, p = 0.001), and anaerobes comprised 58% of CS bacteria vs. 42% of urethral bacteria. PC did not alter urethral IL-8 (median 806 at baseline vs. 1130 pg/ml at 12 months; p = 0.062) and urethral sE-cadherin increased (113,223 vs. 158,385 pg/ml, p = 0.009), despite five- and sevenfold drops in total bacterial and anaerobe abundance after PC, respectively. However, PC dramatically reduced CS levels of sE-cadherin (15,843 vs. 837 pg/ml, p < 0.001) and most cytokines (IL-8; 34 vs. 3 pg/ml, p < 0.001), while reducing total bacterial and anaerobe abundance by 13-fold and 60-fold, respectively (both P ≤ 0.004). CONCLUSIONS: The urethra is immunologically rich with characteristics of an HIV-susceptible tissue site. However, PC had no impact on urethral immunology and may have reduced epithelial integrity, despite modest reductions in total bacteria and anaerobes, suggesting that HIV protection from PC is not mediated via immune or microbiome alterations in the urethra. Video abstract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,879
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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