Genomic evidence of functional diversity in DPANN archaea, from oxic species to anoxic vampiristic consortia
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
DPANN archaea account for half of the archaeal diversity of the biosphere, but with few cultivated representatives, their metabolic potential and environmental functions are poorly understood. The extreme geochemical and environmental conditions in meromictic ice-capped Lake A, in the Canadian High Arctic, provided an isolated, stratified model ecosystem to resolve the distribution and metabolism of uncultured aquatic DPANN archaea living across extreme redox and salinity gradients, from freshwater oxygenated conditions, to saline, anoxic, sulfidic waters. We recovered 28 metagenome-assembled genomes (MAGs) of DPANN archaea that provided genetic insights into their ecological function. Thiosulfate oxidation potential was detected in aerobic Woesearchaeota, whereas diverse metabolic functions were identified in anaerobic DPANN archaea, including degradation and fermentation of cellular compounds, and sulfide and polysulfide reduction. We also found evidence for "vampiristic" metabolism in several MAGs, with genes coding for pore-forming toxins, peptidoglycan degradation, and RNA scavenging. The vampiristic MAGs co-occurred with other DPANNs having complementary metabolic capacities, leading to the possibility that DPANN form interspecific consortia that recycle microbial carbon, nutrients and complex molecules through a DPANN archaeal shunt, adding hidden novel complexity to anaerobic microbial food webs.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,009 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle