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Enregistrement W4205968140 · doi:10.5376/lgg.2022.13.0001

Construction and Analysis of a Yeast cDNA Library from <i>Medicago truncatula</i>

2022· article· en· W4205968140 sur OpenAlexvenueno aff
Shuwen Li, Di Dong, Yinruizhi Li, Mengdi Wang, Liebao Han, Tiejun Zhang

Notice bibliographique

RevueLegume Genomics and Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicago truncatulaMedicagocDNA libraryYeastComplementary DNABiologyChemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yeast two-hybrid and one-hybrid technologies are an efficient molecular biology technique for screening protein interactions or protein and DNA interactions, and are an important means for the interaction and regulation of biological macromolecules. In order to obtain a high-capacity  Medicago truncatula  gene library, it provides a basis for further digging the related genes of  Medicago truncatula  and improving the quality of  Medicago truncatula . In this study,  Medicago truncatula  from different tissue sources was selected, and different hormone induction or stress treatments were performed on  Medicago truncatula , using SMART technology to successfully construct a high-capacity  Medicago truncatula  yeast hybrid cDNA library. The library quality test results showed that the library titration number was 5×10 7  CFU/mL, the library capacity was 1.28×10 7  CFU, and the average insert fragment length was greater than 1 000 bp. All 24 clones were able to amplify bands, and the cDNA fragment recombination rate was 100%. The library has high quality and complete genetic information, which meets the requirements of yeast hybrid screening test, and can be applied to the research of gene expression regulation of  Medicago truncatula  and the screening test of interaction protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil0,816

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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