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Enregistrement W4206000152 · doi:10.1242/jeb.243912

Alpha haemoglobin helps high-altitude deer mice breathe more deeply

2022· article· en· W4206000152 sur OpenAlexaboutno aff
Kathryn Knight

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHigh Altitude and Hypoxia
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeromyscusEffects of high altitude on humansDeer mouseBreedAltitude (triangle)Low altitudeAnimal scienceBiologyZoologyPhysiologyEcologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

No self-respecting crime drama would be the same without a liberal sprinkling of blood. Yet, the haemoglobin that gives blood its distinctive shade has a perfectly mundane role, transporting oxygen around the body and returning CO2 to the lungs. The haemoglobin of animals, such as deer mice (Peromyscus maniculatus), that live at high altitude is also specially adapted to pick up oxygen when the air is much thinner than that experienced by species nearer to sea level. But Catherine Ivy from McMaster University, Canada, explains that simply breathing more deeply can also increase the amount of oxygen getting into an animal's body when the air pressure falls: high-altitude deer mice breathe more slowly and deeply than lowland mice. There were also hints that members of the haemoglobin family of proteins that occur in other parts of the body, such as the nervous system, might be able to control how an animal breathes. Could the specialised haemoglobin that allows high-altitude deer mice to carry sufficient oxygen also help the animals breathe more deeply?Ivy and Graham Scott (McMaster University) decided to find out, so they enlisted the help of Zachary Cheviron (University of Montana, USA) and Jay Storz (University of Nebraska, USA) to breed mice that carried specific combinations of the high- and low-altitude haemoglobins, to check how the proteins affected the animals’ breathing. The team, including colleagues from Canada and the USA, collected deer mice from Mount Evans, CO, USA, living at 4350 m, and from Nine Mile Prairie, NB, USA, living at 430 m, before transporting the animals to Cheviron's lab at 978 m in Montana. There, Rena Schweizer, Jonathan Velotta and Shane Campbell-Staton allowed a high-altitude male to have a family with a low-altitude female and those offspring to interbreed before Natalie Gutierrez-Pinto and Chandrasekhar Natarajan (both from University of Nebraska) checked the youngsters’ DNA to be certain which combinations of the high- and low-altitude haemoglobins they carried.Once the mice were a year old, they joined Ivy at McMaster University, where they remained at an altitude of 50 m for 8 weeks before she recorded their breathing as she lowered the air pressure, to simulate the animals climbing in altitude. Then, she transferred the mice to a pressure chamber where she could simulate life at 4300 m and rechecked their breathing after 8 weeks.Sure enough, as the air grew thinner, all of the mice breathed more to compensate for the effective lack of oxygen. However, when Ivy compared the haemoglobin combinations that the mice had inherited with their breathing patterns, it was clear that the animals that had inherited two high-altitude forms of the alpha chain component of haemoglobin were taking particularly slow and deep breaths. In contrast, the mice that only inherited low-altitude versions of the alpha haemoglobin chain breathed more shallowly. And when Ivy compared the breathing patterns of the specially bred mice with the patterns of mice that had arrived directly from the mountains, they were essentially indistinguishable. Having high-altitude versions of the haemoglobin α chain seems to be key to regulating how deer mice breathe.‘Our findings are against the dogma that globins don't affect breathing’, says Ivy, and she is keen to find out whether the red blood cells, or some other tissue, are the source of the haemoglobin α chain that seems to be crucial to the mountain deer mouse's laid-back breathing style.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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