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Enregistrement W4206143629 · doi:10.1002/9781118960608.gbm01269.pub2

<i>Fervidobacterium Emendation</i>

2021· other· en· W4206143629 sur OpenAlexaff
Stéphane L’Haridon, Anne A. Farrell, Olga Zhaxybayeva, Camilla Nesbø

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2021
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThermophileHeterotrophBiologyBacteriaCell wallGenusSalinityBiochemistryChemistryBotanyEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fer.vi.do.bac.te'ri.um. L. masc. adj. fervidus hot: Gr. neut. n. bakterion a small rod: N.L. neut. n. Fervidobacterium a rod that grow at higher temperatures. The genus Fervidobacterium is currently composed of seven described species ( Fervidobacterium changbaicum , Fervidobacterium gondwanense , Fervidobacterium islandicum , Fervidobacterium nodosum , Fervidobacterium pennivorans , Fervidobacterium riparium , and Fervidobacterium thailandense ). They are members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae , order Thermotogales , and family Fervidobacteriaceae . Similar to other Thermotogota , Fervidobacterium spp. are obligately anaerobic heterotrophs . They are thermophilic or hyperthermophilic , with optimum growth temperature of 60–80°C and optimal pH of 6.5–7.8. However, unlike other described Thermotogota , Fervidobacterium spp. grow only at low salinity (0–0.5% NaCl). Sulfur is reduced to H 2 S and stimulates growth, while molecular hydrogen inhibits growth. The cells are Gram‐negative rods and occur individually, in pairs, in filaments, in chains of up to 17 cells in one chain, or as spherical rotund bodies where 10 or more cells share an outer membrane. The majority of the individual cells produce terminal protuberances on one end of the cell (spheroids). Cells size about 0.4–0.6 × 1–40 μm. The cells are sensitive to inhibitors of cell‐wall, protein, and nucleic acid biosynthesis. Known habitats are terrestrial geothermal systems. The genus has also been detected in several types of anthropogenic environments: oil sands, tailing ponds, effluent of pulp and paper industry, and thermophilic microbial fuel cells. Several isolates have important uses in biotechnology; for instance, keratinophilic isolates are known to degrade feathers. DNA G + C content (mol%) : 35–45.8. Type species : Fervidobacterium nodosum Patel et al. 1985, VL19. Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Fervidobacterium is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Thermotogales / Fervidobacteriaceae / Fervidobacterium The genus Fervidobacterium can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Fervidobacterium (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Thermotogales / f__Fervidobacteriaceae / g__Fervidobacterium * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,793
Score d'incertitude au seuil0,975

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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