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Enregistrement W4206187231 · doi:10.1109/bibm52615.2021.9669849

A Graph Attention Neural Network for Diagnosing ASD with fMRI Data

2021· article· en· W4206187231 sur OpenAlexaff
Wutao Yin, Longhai Li, Fang‐Xiang Wu

Notice bibliographique

Revue2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research Council
Mots-clésFunctional magnetic resonance imagingComputer scienceAutism spectrum disorderNeuroimagingGraphArtificial intelligenceGraph theoryResting state fMRIMachine learningPower graph analysisArtificial neural networkPattern recognition (psychology)AutismNeurosciencePsychologyTheoretical computer sciencePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autism Spectrum Disorder (ASD) is a common psychiatric disorder disease that typically causes impaired communication and compromised social interactions. Functional magnetic resonance imaging (fMRI) data is one of the common neuroimaging modalities for understanding human brain functionalities as well as the diagnosis and treatment of brain disorders. There are many successful applications of deep learning to fMRI analytics where fMRI data is mostly considered structured Euclidean grids or time series, and features were usually extracted from the computer vision or time series perspective. Graph neural networks (GNNs) are neural networks that learn the interactions of graphs via message passing between the nodes of graphs. Recently variants of GNNs such as graph attention network (GAT) have demonstrated outstanding performances on many machine learning tasks. In this paper, we proposed a connectivity based graph attention network for autism diagnosis using functional connectivity (FC) patterns obtained from resting-state fMRI (rs-fMRI). We define graphs based on F Cs and statistics of fMRI time series and present a connectivity-based GATs model for fMRI data analysis. The graph-theoretic based approach enables us to pass messages among connectomic (Non-Euclidean) neighborhoods, which is consistent with the brain functional networks. To evaluate the performance of our proposed GAT, we apply the GAT model to the classification of A SD patients from normal controls. Our results show that GAT can effectively capture salient features for ASD classifications in fMRI analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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