Transcriptome Profiling of Lisianthus (<i>Eustoma grandiflorum</i>) under Drought Stress
Notice bibliographique
Résumé
Lisianthus ( Eustoma grandiflorum ) is an important ornamental plant native to North America. So far, the number of basic molecular research reports on Lisianthus is relatively small, especially the research related to the molecular mechanism of response to drought stress. In this experiment, transcriptome second-generation sequencing technology was used to study Lisianthus seedlings under drought stress. The results showed that the transcriptome sequencing data had good quality control results. In order to obtain genetic information on this basis, the sequences were spliced using software such as Trinity and Corset, a total of 102,014 non-redundant genes were obtained, including 2,929 coding genes which were found to belong to 79 transcription factor families after analyzing. Annotating all genes, Zhongguo coffee was found to be the species with the highest comparison similarity. Finally, simple sequence repeat (SSR) analysis was performed on the gene sequences, and all SSR information contained in non-redundant genes and transcription factor coding genes had been obtained. The results of this study can provide candidate molecular resources for subsequent studies on Lisianthus 's response to drought stress in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».