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Enregistrement W4206453600 · doi:10.1101/2022.01.17.476627

Impact of ionizing radiation on the environmental microbiomes of Chernobyl wetlands

2022· preprint· en· W4206453600 sur OpenAlexaff
Elin Videvall, Pablo Burraco, Germán Orizaola

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensASTER
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetHelge Ax:son Johnsons StiftelseMinisterio de Ciencia, Innovación y Universidades
Mots-clésIonizing radiationWetlandMicrobiomeEnvironmental scienceRadioactive contaminationRadionuclideEcologyBiologyContaminationPhysicsBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Radioactive contamination in the form of ionizing radiation can be a devastating pollutant because it has the potential to cause damage to DNA and other biomolecules. Anthropogenic sources of ionizing radiation include accidents in nuclear power plants, such as the one in Chernobyl 1986, which caused long-term radioactive pollution. Studies on animals within radioactive zones have provided us with a greater understanding of how wildlife can persevere despite chronic radiation exposure, however, we still know very little about the effects of radiation on the microbial communities in the environment. Here, we examined the impact of ionizing radiation and other environmental factors on the diversity and composition of environmental microbiomes in the wetlands of Chernobyl. We combined extensive field sampling along a gradient of radiation together with 16S rRNA high-throughput metabarcoding (Illumina NovaSeq). While radiation did not affect the alpha diversity of the microbiomes in sediment, soil, or water, it had a strong effect on the beta diversity, indicating that the microbial composition was affected by ionizing radiation. Specifically, we detected several microbial taxa that were more abundant in areas with high radiation levels within the Chernobyl Exclusion Zone, including bacteria and archaea known to be radioresistant. Overall, our results reveal the existence of rich and diverse microbiomes in Chernobyl wetlands, with multiple taxonomic groups that are able to thrive despite the radioactive contamination. Further field and laboratory-based approaches will help to forecast the functionality and re-naturalization dynamics of radiocontaminated environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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