MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4206507425 · doi:10.1101/2022.01.08.475489

Toxoflavin secreted by <i>Pseudomonas alcaliphila</i> inhibits growth of <i>Legionella pneumophila</i> and its host <i>Vermamoeba vermiformis</i>

2022· preprint· en· W4206507425 sur OpenAlexaff
Sébastien P. Faucher, Sara Matthews, Arvin Nickzad, Passoret Vounba, Deeksha Shetty, Émilie Bédard, Michèle Prévost, Éric Déziel, Kiran Paranjape

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensPolytechnique MontréalInstitut National de la Recherche ScientifiqueMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLegionella pneumophilaMicrobiologyBiologyLegionellaPseudomonasPseudomonas aeruginosaBacteriaBiofilmAgar16S ribosomal RNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Legionella pneumophila is a natural inhabitant of water systems. From there, it can be transmitted to humans by aerosolization resulting in severe pneumonia. Most large outbreaks are caused by cooling towers contaminated with L. pneumophila . The resident microbiota of the cooling tower is a key determinant for the colonization and growth of L. pneumophila . The genus Pseudomonas correlates negatively with the presence of L. pneumophila , but it is not clear which species is responsible. Therefore, we identified the Pseudomonas species inhabiting 14 cooling towers using a Pseudomonas -specific 16S rRNA amplicon sequencing strategy. Cooling towers free of L. pneumophila contained a high relative abundance of members from the Pseudomonas alcaliphila/oleovorans phylogenetic cluster. In vitro , P. alcaliphila JCM 10630 inhibited the growth of L. pneumophila on agar plates. Analysis of the P. alcaliphila genome revealed the presence of a genes cluster predicted to produce toxoflavin. L. pneumophila growth was inhibited by pure toxoflavin and by extract from P. alcaliphila culture found to contain toxoflavin by LC-ESI-MS. In addition, toxoflavin inhibits growth of Vermameoba vermiformis , a host cell of L. pneumophila . Our study indicates that P. alcaliphila may be important to restrict growth of L. pneumophila in water systems through the production of toxoflavin. A sufficiently high concentration is likely not achieved in the bulk water but might have a local inhibitory effect such as in biofilm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetLegionella and Acanthamoeba researchTravaux en français237 207