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Enregistrement W4206514926 · doi:10.1109/bibm52615.2021.9669364

Problem Oriented Diagnostic Service for Describing Clinical Cases based on the GraphQL POMR Approach

2021· article· en· W4206514926 sur OpenAlexaff
Sabah Mohammed, Jinan Fiaidhi, Darien Sawyer

Notice bibliographique

Revue2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceSchema (genetic algorithms)StructuringWorkflowSOAPService (business)Medical diagnosisArtificial intelligenceProcess (computing)Software engineeringWorld Wide WebMachine learningProgramming languageDatabaseMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since late 1960s when Dr. Larry Weed painted the roadmap to the formal process of medical diagnosis and the way it should structured around problem list based on what he calls SOAP note (Subjective, Objective, Assessment and the Plan), no real implementation or integration of his vision in providing the 'glue' to link the number of required layers, including the SOAP structuring, semantics of assessments and workflows, clinical decision support systems logic, task planning and querying each case based on flexible schema. Diagnosis, as Weed put it, a process that can describe a clear, logical and systematic approach for clinical diagnosis based on Weed's approach when a patient encountered a clinical issue. This process need to be modeled a service that can integrate with the other clinical systems and services including the medical record systems. In this article we are proposing such service based on Weeds approach for the clinical diagnosis purposes. The described service starts with a SOAP schema that utilizes the GraphQL standard and its associated toolkits to offer physicians and pre-clerkships the mean for describing diagnosis of clinical cases according to the Weed's approach. Particular attention has been given to processing and refining of the of SOAP diagnosis note through primitives like create, retrieve, update and delete (CRUD).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,149
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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