MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4206597964 · doi:10.1109/bibm52615.2021.9669613

Temporal Graph Representation Learning for Autism spectrum disorder Brain Networks

2021· article· en· W4206597964 sur OpenAlexaff
Peng Cao, Guangqi Wen, Lanting Li, Xiaoli Liu, Jinzhu Yang, Osmar R. Zai͏̈ane

Notice bibliographique

Revue2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésComputer scienceGraph embeddingDynamic functional connectivityGraphAutism spectrum disorderArtificial intelligenceEmbeddingDiscriminative modelAutismFunctional magnetic resonance imagingNeuroimagingCluster analysisRecurrent neural networkPattern recognition (psychology)Artificial neural networkTheoretical computer scienceNeurosciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modeling spatio-temporal dynamics in functional brain networks is critical for underlying the functional mechanism of autism spectrum disorder (ASD). In our study, we propose an end-to-end framework called temporal graph representation learning for brain networks, which thoroughly captures spatio-temporal features in resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) data. Specifically, we first transform rs-fMRI time-series into temporal multi-graph using a sliding window technique. A temporal multi-graph clustering is then designed to eliminate the inconsistency of the temporal multi-graph series. Then, a graph structure aware LSTM (GSA-LSTM) is proposed to capture the spatio-temporal embedding for temporal graphs. The proposed GSA-LSTM can not only capture discriminative features for prediction but also impute the incomplete graphs for the temporal multi-graph series. Extensive experiments on autism brain imaging data exchange (ABIDE) dataset shows the effectiveness of our proposed framework. The results demonstrate that the proposed dynamic brain network embedding learning outperforms the state of-the-art brain network classification models. Furthermore, the obtained clustering results are consistent with the previous neuroimaging-derived evidence of biomarkers for autism spectrum disorder (ASD).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,890
Score d'incertitude au seuil0,731

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revue2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)Même sujetFunctional Brain Connectivity StudiesTravaux en français237 207