Effect of short-term hindlimb immobilization on skeletal muscle atrophy and the transcriptome in a low compared with high responder to endurance training model
Notice bibliographique
Résumé
Skeletal muscle atrophy is a physiological response to disuse, aging, and disease. We compared changes in muscle mass and the transcriptome profile after short-term immobilization in a divergent model of high and low responders to endurance training to identify biological processes associated with the early atrophy response. Female rats selectively bred for high response to endurance training (HRT) and low response to endurance training (LRT; n = 6/group; generation 19) underwent 3 day hindlimb cast immobilization to compare atrophy of plantaris and soleus muscles with line-matched controls (n = 6/group). RNA sequencing was utilized to identify Gene Ontology Biological Processes with differential gene set enrichment. Aerobic training performed prior to the intervention showed HRT improved running distance (+60.6 ± 29.6%), while LRT were unchanged (-0.3 ± 13.3%). Soleus atrophy was greater in LRT vs. HRT (-9.0 ±8.8 vs. 6.2 ±8.2%; P<0.05) and there was a similar trend in plantaris (-16.4 ±5.6% vs. -8.5 ±7.4%; P = 0.064). A total of 140 and 118 biological processes were differentially enriched in plantaris and soleus muscles, respectively. Soleus muscle exhibited divergent LRT and HRT responses in processes including autophagy and immune response. In plantaris, processes associated with protein ubiquitination, as well as the atrogenes (Trim63 and Fbxo32), were more positively enriched in LRT. Overall, LRT demonstrate exacerbated atrophy compared to HRT, associated with differential gene enrichments of biological processes. This indicates that genetic factors that result in divergent adaptations to endurance exercise, may also regulate biological processes associated with short-term muscle unloading.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».