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Enregistrement W4206792393 · doi:10.1111/sji.13144

Positive selection of immune repertoires: A short further history

2022· article· en· W4206792393 sur OpenAlexafffund
Donald R. Forsdyke

Notice bibliographique

RevueScandinavian Journal of Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesQueen's University
Mots-clésImmune systemBiologyContext (archaeology)Negative selectionOrganismSelection (genetic algorithm)AntigenImmunityHost (biology)ImmunologyEvolutionary biologyGeneticsGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The importance of the negative selection of self-reacting cells from immune repertoires was easily recognized since it would militate against autoimmune disease. However, while the existence of positive selection in the auditioning of newly formed immune cells is now recognized, it is taking longer to understand its role. With the removal or suppression by negative selection of a subset of immune cells that self-react, would the specificities of remaining immune cells range widely to confront the universe of 'non-self' antigens, including some borne by potential microbial pathogens? Alternatively, from among those remaining immune cells, could some be picked out (positively selected) based on 'advanced knowledge' of some character likely to be common to those pathogens? To exploit 'holes' created by negative selection, it was predicted that pathogens would attempt to mimic their hosts by progressive stepwise mutation towards host 'self'-a process entailing passage through a host anti-'near-self-reactivity' arena. Anticipating this, those hosts that over evolutionary time 'learned' to positively select from developing immune repertoires, cells with reactivities against 'near-self', would be advantaged by natural selection. The benefits of this narrowing of the range of host immune reactivities are now clearer and may solve Burnet's paradox, which concerns the ability of an organism's immune cells to attack its own cancer cells. However, while supporting this in the context of T cell immunity, Manczinger and his colleagues now suggest that some wily pathogens may be exploiting their hosts' narrow defence foci by 'seeking', through mutation, dissimilarity from host 'self'.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,010
Communication savante0,0050,008
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0040,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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