P204 Endotrophin (PRO-C6) is associated with MRE confirmed intestinal strictures and Protein FingerPrint biomarkers of collagen degradation is associated with ulcerations in paediatric Crohn’s disease patients – results from the ImageKids study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Most patients with inflammatory bowel disease (IBD) eventually develop intestinal fibrosis due to increased extracellular matrix (ECM) remodelling. There is a huge medical need for non-invasive serological biomarkers for intestinal fibrosis and inflammation, as magnetic resonance enterography (MRE) and endoscopy are less desirable for repeated monitoring. Therefore, we aimed to investigate Protein FingerPrint assays (PFA) of collagen remodelling and citrullinated vimentin as surrogate markers of intestinal stenosis and tissue inflammation in paediatric Crohn’s disease (pCD) patients. Methods This is a proteomics planned sub-study of the multi-center prospective ImageKids study that enrolled children with CD undergoing MRE and colonoscopy concurrently (ImageKids study: NCT01881490). We included those in Tanner stage 5 with available serum sample for these initial analyses, as age and stage of physical development affects ECM remodelling. Serum from healthy age and gender matched controls were obtained from Central BioHub. PFA biomarkers of collagen degradation (C1M, C3M, C4M, C6M), collagen formation (PRO-C1, PRO-C3, PRO-C4, PRO-C5, PRO-C6) and citrullinated vimentin (VICM) were measured. Intestinal stenosis was determined by MRE and mucosal inflammation by the SES-CD. Student’s t-test, Pearson r correlation and one-way-ANOVA with Tukey correction was applied for statistical analysis. Results 50 pCD adolescents were included (mean age ± 14.53 years, 30 (60%) females, 11 (22%) in clinical remission and 18 (36%) with moderate-severe disease), along with 83 serum samples from healthy controls. SES-CD correlated with C1M (r=0.58, p=0.0001), C3M (r=0.46, p=0.0033), C6M (r=0.48, p=0.0021), PRO-C4 (r=0.58, p=0.0001), VICM (r=0.48, p=0.0018), PRO-C1 (r=-0.39, p=0.015) and PRO-C3 (r=-0.33, p=0.043). C1M (p<0.0001), C3M (p<0.05), and C6M p<0.001) were elevated in patients with severe ulcers compared to patients without ulcers, and vice versa for VICM (figure 1). PRO-C6 (p<0.05) was significantly elevated between patients with vs. without intestinal stenosis, and PRO-C5 (p<0.01), C4M (p<0.05), and PRO-C4 (p<0.05) were significantly lower (figure 2). Conclusion PFA biomarkers of collagen degradation and formation are associated with inflammation and/or intestinal fibrosis pCD. Furthermore, the biomarkers C1M, C3M, C4M, C6M, reflecting mucosal damage and tissue inflammation, were elevated in pCD patients with severe ulcers. PRO-C6, PRO-C5 and C4M were the best PFA biomarkers to reflect MRE-confirmed stenosis. PFA biomarker of collagen remodelling could potentially be applied as surrogate biomarkers for monitoring of mucosal damage/tissue inflammation and fibrostenotic stricture development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».