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Enregistrement W4206984086 · doi:10.1101/2022.01.19.476693

SARS-CoV-2 impairs interferon production via NSP2-induced repression of mRNA translation

2022· preprint· en· W4206984086 sur OpenAlexafffund
Jung‐Hyun Choi, Xu Zhang, Christine Zhang, David L. Dai, Jun Luo, Reese Jalal Ladak, Qian Li, Shane Wiebe, Alex C.H. Liu, Xiaozhuo Ran, Jiaqi Yang, Parisa Naeli, Aitor Garzia, Lele Zhou, Niaz Mahmood, Qiyun Deng, Mohamed Elaish, Rongtuan Lin, Tom C. Hobman, Jerry Pelletier, Tommy Alain, Silvia M. Vidal, Thomas F. Duchaîne, Mohammad T. Mazhab‐Jafari, Xiaojuan Mao, Seyed Mehdi Jafarnejad, Nahum Sonenberg

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of AlbertaUniversity of ManitobaPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkChildren's Hospital of Eastern OntarioChristie (Canada)McGill University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilDirectorate for Biological SciencesTerry Fox Research InstituteNational Research Foundation of KoreaQueen's UniversityNational Research Foundation
Mots-clésMessenger RNATranslation (biology)Innate immune systemInterferonPsychological repressionBiologyCell biologyImmune systemProtein biosynthesismicroRNAVirologyRNAMechanism (biology)ImmunologyGene expressionMolecular biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Viruses evade the innate immune response by suppressing the production or activity of cytokines such as type I interferons (IFNs). Here we report the discovery of a novel mechanism by which the SARS-CoV-2 virus co-opts an intrinsic cellular machinery to suppress the production of the key immunostimulatory cytokine IFN-β. We reveal that the SARS-CoV-2 encoded Non-Structural Protein 2 (NSP2) directly interacts with the cellular GIGYF2 protein. This interaction enhances the binding of GIGYF2 to the mRNA cap-binding protein 4EHP, thereby repressing the translation of the Ifnb1 mRNA. Depletion of GIGYF2 or 4EHP significantly enhances IFN-β production, leading to reduced viral infection. Our findings reveal a new target for rescuing the antiviral innate immune response to SARS-CoV-2 and other RNA viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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