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Enregistrement W4206986038 · doi:10.1097/shk.0000000000001915

Functional Transcriptomic Studies of Immune Responses and Endotoxin Tolerance in Early Human Sepsis

2022· article· en· W4206986038 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueShock · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésSepsisImmune systemEx vivoIn vivoInflammationTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Limited studies have functionally evaluated the heterogeneity in early ex vivo immune responses during sepsis. Our aim was to characterize early sepsis ex vivo functional immune response heterogeneity by studying whole blood endotoxin responses and derive a transcriptional metric of ex vivo endotoxin response. METHODS: Blood collected within 24 h of hospital presentation from 40 septic patients was divided into two fractions and incubated with media (unstimulated) or endotoxin. Supernatants and cells were isolated, and responses measured using: supernatant cytokines, lung endothelial permeability after supernatant exposure, and RNA expression. A transcriptomic signature was derived in unstimulated cells to predict the ex vivo endotoxin response. The signature was tested in a separate cohort of 191 septic patients to evaluate for association with clinical outcome. Plasma biomarkers were quantified to measure in vivo host inflammation. RESULTS: Ex vivo response to endotoxin varied and was unrelated to immunosuppression, white blood cell count, or the causative pathogen. Thirty-five percent of patients demonstrated a minimal response to endotoxin, suggesting early immunosuppression. High ex vivo cytokine production by stimulated blood cells correlated with increased in vitro pulmonary endothelial cell permeability and was associated with attenuated in vivo host inflammation. A four-gene signature of endotoxin response detectable without the need for a functional assay was identified. When tested in a separate cohort of septic patients, its expression was inversely associated with hospital mortality. CONCLUSIONS: An attenuated ex vivo endotoxin response in early sepsis is associated with greater host in vivo inflammation and a worse clinical outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,332
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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