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Enregistrement W4207033664 · doi:10.1016/j.dib.2022.107863

The PaleoArchiNeo (PAN) human brain atlas: A dataset on a standard neuroanatomical MRI template following a phylogenetic approach

2022· article· en· W4207033664 sur OpenAlexafffund
Maryna Zhernovaia, Mahsa Dadar, Sawsan M. Mahmoud, Yashar Zeighami, Josefina Maranzano

Notice bibliographique

RevueData in Brief · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesUniversité du Québec à Trois-Rivières
Mots-clésAtlas (anatomy)Brain atlasPhylogenetic treeHuman brainResearch articleComputer scienceBiologyArtificial intelligenceAnatomyNeuroscienceLibrary science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cortical atlases provide consistent divisions of the human cortex into areas that have common structural as well as meaningful and distinctive functional characteristics. They constitute a fundamental tool to study and quantify changes in healthy and pathological states. Historically, the most widely used atlases follow the cytoarchitecture described by Brodmann and/or the myeloarchitectonic characteristics described by Vogt-Vogt. These histological approaches have since been combined to the standard anatomical nomenclature of gyri and sulci, referring to the corresponding cytoarchitectonic area(s) present in a gyrus, when applicable or necessary (e.g. area 4 of Brodmann in the pre-central gyrus). More recently, common functional features depicted by resting state functional MRI have guided the division of the cortex into functional regions of interest. However, to date, there are no human MRI atlases that divide the cortex considering the common evolutionary changes experienced by the mammalian cortex. Hence, the present dataset describes the PaleoArchiNeo (PAN) Human Brain, a voxel-based atlas that divides the human cortex into five regions of interest (ROIs) following a phylogenetic approach: 1- archicortex, 2- paleocortex, 3- peri-archicortex, 4- proisocortex, 5- neocortex, and thirty neocortical sub-ROIs that follow the gyral Terminologia Anatomica.The masks of the ROIs and sub-ROIs were segmented on the T1-weighted MNI ICBM 152 2009c symmetric average brain MRI model, the latest version of the most widely used standard brain template. The segmentations have been performed manually by anatomist experts, following the MRI anatomical landmarks that have been previously described, correlated, and validated with histology by other groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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