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Enregistrement W4210241596 · doi:10.1101/2022.02.03.478032

Proteostasis in ice: The role of heat shock proteins and ubiquitin in the freeze tolerance of the intertidal mussel, <i>Mytilus trossulus</i>

2022· preprint· en· W4210241596 sur OpenAlexafffundabout
Lauren T. Gill, Jessica Kennedy, Katie E. Marshall

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversities Space Research Association
Mots-clésIntertidal zoneBiologyMusselMytilusHsp70Heat shock proteinUbiquitinEcologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The bay mussel, Mytilus trossulus , is one of the few animals that can survive internal ice formation. Freeze tolerant intertidal animals, like M. trossulus , may freeze and thaw many times during the winter, depending on air and ocean temperatures. Freezing can cause protein denaturation, leading to an induction of the heat shock response with expression of proteins like HSP70, and an increase in ubiquitin conjugated proteins. There has been little work on the mechanisms of freeze tolerance in intertidal species, limiting our understanding of this survival strategy. Additionally, this limited research has focused solely on the effects of single freezing events, but the act of repeatedly crossing the freezing threshold may present novel physiological or biochemical stressors that have yet to be discovered. We predicted that repeated freeze exposures would increase mortality, upregulate HSP70 expression, and increase ubiquitin conjugates in mussels, relative to single, prolonged freeze exposures. Mytilus trossulus from Vancouver, Canada were repeatedly frozen for a combination of 1 × 8 hours, 4 × 2 hours, or 2 × 4 hours. We then compared mortality, HSP70 expression, and ubiquitin quantity across experimental groups. We found a single 8-hour freeze caused significantly more mortality than repeated freeze-thaw cycles. We also found that HSP70 and ubiquitin expression was upregulated exclusively after freeze-thaw cycles, suggesting that freeze-thaw cycles offer a period of damage repair between freezes. This indicates that freeze-thaw cycles, which happen naturally in the intertidal, are crucial for M. trossulus survival in sub-zero temperatures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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