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Enregistrement W4210278557 · doi:10.1002/cbic.202200061

Synthetic Neoglycoconjugates of Hepta‐ and Nonamannoside Ligands for Eliciting Oligomannose‐Specific HIV‐1‐Neutralizing Antibodies

2022· article· en· W4210278557 sur OpenAlexaff
Matteo Cattin, J. Bruxelle, Kurtis Ng, Markus Blaukopf, Ralph Pantophlet, Paul Kosma

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésAnomerGlycanChemistryEpitopeAntibodyGlycosylationConjugateImmunoglobulin Fab FragmentsStereochemistryFragment crystallizable regionBiochemistryCombinatorial chemistryGlycoproteinPeptide sequenceBiologyComplementarity determining regionReceptorImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Oligomannose‐type glycans on the spike protein of HIV‐1 constitute relevant epitopes to elicit broadly neutralizing antibodies (bnAbs). Herein we describe an improved synthesis of α‐ and β‐linked hepta‐ and nonamannosyl ligands that were subsequently converted into BSA and CRM 197 neoglycoconjugates. We assembled the ligands from anomeric 3‐azidopropyl spacer glycosides from select 3‐O‐protected thiocresyl mannoside donors. Chain extensions were achieved using [4+3] or [4+5] block synthesis of thiocresyl and trichloroacetimidate glycosyl donors. Subsequent global deprotection generated the 3‐aminopropyl oligosaccharide ligands. ELISA binding data obtained with the β‐anomeric hepta‐ and nonamannosyl conjugates with a selection of HIV‐1 bnAbs showed comparable binding of both mannosyl ligands by Fab fragments yet lesser binding of the nonasaccharide conjugate by the corresponding IgG antibodies. These results support previous observations that a complete Man 9 structure might not be the preferred antigenic binding motif for some oligomannose‐specific antibodies, and have implications for glycoside designs to elicit oligomannose‐targeted HIV‐1‐neutralizing antibodies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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