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Enregistrement W4210324874 · doi:10.3389/fevo.2022.822935

Metabolic Phenotype of Daphnia Under Hypoxia: Macroevolution, Microevolution, and Phenotypic Plasticity

2022· article· en· W4210324874 sur OpenAlexafffund
Tingyat M. Lee, K. Westbury, Christopher J. Martyniuk, William A. Nelson, Christopher D. Moyes

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyHypoxia (environmental)Phenotypic plasticityDaphniaLactate dehydrogenasePhenotypeEcologyDaphnia pulexGlycolysisZoologyGeneMetabolismCrustaceanOxygenBiochemistryEnzymeChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Daphnia is a freshwater crustacean that is able to upregulate hemoglobin (Hb) in response to hypoxia, imparting a red color. We combine multiple field surveys across season with a lab experiment to evaluate changes in the metabolic phenotype of Daphnia in relation to environmental hypoxia. Looking at the zooplankton community, we found that D. pulicaria was restricted to lakes with a hypoxic hypolimnion. Comparing D. pulicaria with different amounts of Hb, red animals showed higher mRNA levels for several Hb genes, whereas most glycolytic genes showed red/pale differences of less than 50%. We also observed seasonal changes in the metabolic phenotype that differed between red and pale animals. Hb was upregulated early in the season in hypoxic lakes, and a relationship between Hb and lactate dehydrogenase only emerged later in the season in a temporal pattern that was lake specific. To evaluate whether these differences were due to specific lake environments or microevolutionary differences, we tested the induction of genes under controlled hypoxia in isofemale lines from each of four lakes. We found a strong response to 18 h hypoxia exposure in both Hb and lactate dehydrogenase mRNA, although the magnitude of the acute response was greater than the steady state differences in mRNA levels between pale and red Daphnia . The baseline expression of Hb and lactate dehydrogenase also varied between isofemale lines with different lake origins. These results, in combination with comparison of glycogen measurements, suggests that Hb functions primarily to facilitate oxygen delivery, mitigating systemic hypoxia, rather than an oxygen store. The combination of lab and field studies suggest that the metabolic phenotype of the animal is influenced by both microevolutionary differences (within and between lakes) as well as the spatial and temporal environmental heterogeneity of the lakes. The differences between Daphnia species, and the unexpected lack of hypoxia sensitivity of select glycolytic genes provide evidence of macroevolutionary differences in metabolic strategies to cope with hypoxia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,559

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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