Molecular characterization of Spodoptera litura Nucleopolyhedrovirus (SlNPV) Labuhan Batu isolate
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Spodoptera litura F. is a new pest that potentially becomes a serious pest threatening palm oil industry. The control can be carried out using biological control agents S.litura Nucleopolyhedrovirus ( Sl NPV). Molecular approach using polymerase chain reaction (PCR) has been used to characterize the Sl NPV isolate. The aim of this study was to determine the molecular characteristics of Sl NPV Labuhan Batu isolate based on DNA sequence analysis. The NPV isolate was collected from oil palm plantation Negeri Lama Estate Group, PT. Hari sawit Jaya, Asian Agri, Labuhan Batu. The Sl NPV DNA extraction was conducted using the DNA gSYNC kit. The amplification of Sl NPV DNA was done by specific primers with oligonucleotide sequences forward 5′-ACGTTACGATCTAGATCC-3′ and reverse 5′-AACGTTAGACAGACATAT-3′ with ±700bp of amplicon. Homology and phylogeny characteristics were used to determine the relationship of Sl NPV isolate from Labuhan Batu to NPV from other countries were reported in the GeneBank of National Center for Biotechnology Information (NCBI). The results showed that Sl NPV isolate from Labuhan Batu had the closest related to Sl NPV from Australia, Sli NPV from Canada and Sl NPV from China, with the similarity percentage 100%, 96% and 90% respectively. They belong to the same group as the NPVs that infected the Spodoptera genus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».