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Enregistrement W4210335803 · doi:10.1088/1755-1315/974/1/012011

Molecular characterization of Spodoptera litura Nucleopolyhedrovirus (SlNPV) Labuhan Batu isolate

2022· article· en· W4210335803 sur OpenAlexaboutno aff
D P Sinambela, Darma Bakti, Maryani Cyccu Tobing, YM Kusumah

Notice bibliographique

RevueIOP Conference Series Earth and Environmental Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSpodoptera lituraBiologyAmpliconVeterinary medicinePEST analysisPolymerase chain reactionHorticultureBiotechnologyBotanyLepidoptera genitaliaMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spodoptera litura F. is a new pest that potentially becomes a serious pest threatening palm oil industry. The control can be carried out using biological control agents S.litura Nucleopolyhedrovirus ( Sl NPV). Molecular approach using polymerase chain reaction (PCR) has been used to characterize the Sl NPV isolate. The aim of this study was to determine the molecular characteristics of Sl NPV Labuhan Batu isolate based on DNA sequence analysis. The NPV isolate was collected from oil palm plantation Negeri Lama Estate Group, PT. Hari sawit Jaya, Asian Agri, Labuhan Batu. The Sl NPV DNA extraction was conducted using the DNA gSYNC kit. The amplification of Sl NPV DNA was done by specific primers with oligonucleotide sequences forward 5′-ACGTTACGATCTAGATCC-3′ and reverse 5′-AACGTTAGACAGACATAT-3′ with ±700bp of amplicon. Homology and phylogeny characteristics were used to determine the relationship of Sl NPV isolate from Labuhan Batu to NPV from other countries were reported in the GeneBank of National Center for Biotechnology Information (NCBI). The results showed that Sl NPV isolate from Labuhan Batu had the closest related to Sl NPV from Australia, Sli NPV from Canada and Sl NPV from China, with the similarity percentage 100%, 96% and 90% respectively. They belong to the same group as the NPVs that infected the Spodoptera genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,474

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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