Characterization of Gfat1 (zeppelin) and Gfat2, Essential Paralogous Genes Which Encode the Enzymes That Catalyze the Rate-Limiting Step in the Hexosamine Biosynthetic Pathway in Drosophila melanogaster
Notice bibliographique
Résumé
The zeppelin (zep) locus is known for its essential role in the development of the embryonic cuticle of Drosophila melanogaster. We show here that zep encodes Gfat1 (Glutamine: Fructose-6-Phosphate Aminotransferase 1; CG12449), the enzyme that catalyzes the rate-limiting step in the hexosamine biosynthesis pathway (HBP). This conserved pathway diverts 2%–5% of cellular glucose from glycolysis and is a nexus of sugar (fructose-6-phosphate), amino acid (glutamine), fatty acid [acetyl-coenzymeA (CoA)], and nucleotide/energy (UDP) metabolism. We also describe the isolation and characterization of lethal mutants in the euchromatic paralog, Gfat2 (CG1345), and demonstrate that ubiquitous expression of Gfat1+ or Gfat2+ transgenes can rescue lethal mutations in either gene. Gfat1 and Gfat2 show differences in mRNA and protein expression during embryogenesis and in essential tissue-specific requirements for Gfat1 and Gfat2, suggesting a degree of functional evolutionary divergence. An evolutionary, cytogenetic analysis of the two genes in six Drosophila species revealed Gfat2 to be located within euchromatin in all six species. Gfat1 localizes to heterochromatin in three melanogaster-group species, and to euchromatin in the more distantly related species. We have also found that the pattern of flanking-gene microsynteny is highly conserved for Gfat1 and somewhat less conserved for Gfat2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».