<i>Dickeya solani, Pectobacterium atrosepticum</i>and<i>Pseudomonas asplenii</i>: causal agents of bacterial soft rot in cyclamen plants (<i>Cyclamen persicum</i>Mill.) in Colombia
Notice bibliographique
Résumé
Cyclamen (Cyclamen persicum Mill.) is an ornamental plant affected by various phytosanitary issues including bacterial soft rots, which cause crop losses of 20% worldwide. In Colombia, however, the symptoms of bacterial soft rots are not well described and the causal agents are unknown. This study aimed to characterize the bacterial soft rot disease according to its symptoms, and identify its causal agents at the species level. For this purpose, we visited nurseries in the municipality of San Antonio del Tequendama, Colombia, and selected diseased plants to describe symptoms, and to isolate and characterize pathogens using morphological, biochemical, and molecular methods. Soft rotting activity in potato tubers and pathogenicity in cyclamen plants also was evaluated. Six symptoms were found to be associated with the disease, namely: wilt, soft corm, bacterial exudates on corms, root rot, soft rot and necrotic soft rot on petioles and peduncles. Of 47 isolates, seven were pathogenic: one from the soft corms; two from petioles with soft rot; two from petioles with necrotic soft rot; and two from root rot. A multiple correspondence analysis clustered isolates in the genera Pseudomonas, Dickeya and Pectobacterium based on the morphological, biochemical, and pathogenic characteristics. A multi-locus analysis (MLSA) based on sequencing of the 16S rDNA region and housekeeping genes (gapA, icdA, mdh, pgi, rpoB and rpoD) confirmed the bacterial species Pseudomonas asplenii, Dickeya solani and Pectobacterium atrosepticum as the causal agents of cyclamen bacterial soft rot in Colombia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».