Faculty Opinions recommendation of Temporal regulation of EGF signalling networks by the scaffold protein Shc1.
Notice bibliographique
Résumé
Cell-surface receptors frequently use scaffold proteins to recruit cytoplasmic targets, but the rationale for this is uncertain. Activated receptor tyrosine kinases, for example, engage scaffolds such as Shc1 that contain phosphotyrosine (pTyr)-binding (PTB) domains. Using quantitative mass spectrometry, here we show that mammalian Shc1 responds to epidermal growth factor (EGF) stimulation through multiple waves of distinct phosphorylation events and protein interactions. After stimulation, Shc1 rapidly binds a group of proteins that activate pro-mitogenic or survival pathways dependent on recruitment of the Grb2 adaptor to Shc1 pTyr sites. Akt-mediated feedback phosphorylation of Shc1 Ser 29 then recruits the Ptpn12 tyrosine phosphatase. This is followed by a sub-network of proteins involved in cytoskeletal reorganization, trafficking and signal termination that binds Shc1 with delayed kinetics, largely through the SgK269 pseudokinase/adaptor protein. Ptpn12 acts as a switch to convert Shc1 from pTyr/Grb2-based signalling to SgK269-mediated pathways that regulate cell invasion and morphogenesis. The Shc1 scaffold therefore directs the temporal flow of signalling information after EGF stimulation. PMID: 23846654 Funding information This work was supported by: Canadian Institutes of Health Research, Canada Grant ID: MOP-13466-6849 Canadian Institutes of Health Research, Canada Grant ID: 13466-4 Canadian Institutes of Health Research, Canada Grant ID: 13466-3 Canadian Institutes of Health Research, Canada Grant ID: 13466-2
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,470 | 0,217 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».