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Enregistrement W4210613377 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.lb188

Ubiquitination of the transcription factor c‐maf is mediated by multiple lysine residues (LB188)

2014· article· en· W4210613377 sur OpenAlexaff
Zubin Zhang, Guodong Chen, Xin Xu, Jiefei Tong, Kunkun Han, Biyin Cao, Michael F. Moran, Xinliang Mao

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLysineUbiquitinTranscription factorMutantBiologyProteasomeChemistryBiochemistryCell biologyAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transcription factor c‐MAF belongs to the family of basic leucine zipper transcription factors including c‐fos and c‐jun. Previous studies suggested that c‐Maf could be polyubiquitinated followed by degradation in the proteasomes, but the mechanism is not defined. Theoretically, any lysine residues in c‐MAF could be ubiquitinated. In the present study, we tried to find out the specific lysine residues mediating c‐MAF ubiquitination. Through a series of mutational screenings from lysine (K) to arginine (R), we found that any single lysine mutation (K to R) failed to prevent c‐MAF ubiquitination, and a single lysine residue failed to mediate c‐MAF ubiquitination, which indicated that multiple lysine residues were required for c‐MAF ubiquitination. Bioinformatics and computing analyses revealed that K85 and K350 could mediate c‐MAF ubiquitination, which was confirmed at the cell‐based assays. However, this duo was not the only pair because the K85R/K350R mutant could also be ubiquitinated. Functionally, both M12 (K85/K350) and W12 (K85R/K350R) mutants increased cyclin D2 promoter‐driven luciferase activity, but they were less potent than the lysine‐free counterpart (M14). Therefore, we demonstrated that c‐MAF ubiquitination is mediated by multiple lysine residues, of which K85 and K350 are sufficient but not the only duo in mediating the c‐MAF ubiquitination. Moreover, c‐MAF was found to be degraded by lysosomes. This study added a novel insight for c‐MAF functional modularity, suggesting that c‐MAF stability is strictly regulated. Grant Funding Source : National Natural Science Foundation of China

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,214

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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