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Enregistrement W4210701828 · doi:10.1242/jeb.243293

Blending physiology and RNAseq to provide new insights into regulation of epithelial transport: switching between ion secretion and reabsorption

2022· review· en· W4210701828 sur OpenAlexaff
Dennis Kolosov, Michael J. O’Donnell

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReabsorptionMalpighian tubule systemTubuleCell biologyHindgutBiologyLumen (anatomy)Apical membraneIon transporterIon channelMechanosensationInternal medicineNephronChemistryEndocrinologyEpitheliumAnatomyKidneyReceptorBiochemistryMidgut

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This Review addresses the means by which epithelia change the direction of vectorial ion transport. Recent studies have revealed that insect Malpighian (renal) tubules can switch from secreting to reabsorbing K+. When the gut of larval lepidopterans is empty (during the moult cycle) or when the larvae are reared on K+-deficient diet, the distal ileac plexus segment of the tubule secretes K+ from the haemolymph into the tubule lumen. By contrast, in larvae reared on K+-rich diet, ions and fluid are reabsorbed from the rectal lumen into the perinephric space surrounding the cryptonephridial tubules of the rectal complex. Ions and fluid are then transported from the perinephric space into the lumen of the cryptonephridial tubules, thus supplying the free segments of the tubule downstream. Under these conditions, some of the K+ and water in the tubule lumen is reabsorbed across the cells of the distal ileac plexus, allowing for expansion of haemolymph volume in the rapidly growing larvae, as well as recycling of K+ and base equivalents. RNA sequencing data reveal large-scale changes in gene transcription that are associated with the switch between ion secretion and ion reabsorption by the distal ileac plexus. An unexpected finding is the presence of voltage-gated, ligand-gated and mechanosensitive ion channels, normally seen in excitable cells, in Malpighian tubules. Transcriptomic surveys indicate that these types of channels are also present in multiple other types of vertebrate and invertebrate epithelia, suggesting that they may play novel roles in epithelial cell signalling and regulation of epithelial ion transport.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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