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Enregistrement W4210730907 · doi:10.1093/rheumatology/keac015

Lymphocyte subset abnormalities in early severe scleroderma favor a Th2 phenotype and are not altered by prior immunosuppressive therapy

2022· article· en· W4210730907 sur OpenAlexaff
Ankoor R. Shah, Jan Storek, Rob Woolson, Ashley Pinckney, Lynnette Keyes-Elstein, Paul K. Wallace, Peter A. McSweeney, Maureen D. Mayes, Leslie J. Crofford, Mary Ellen Csuka, Kristine Phillips, Dinesh Khanna, Robert W. Simms, Karen K. Ballen, Sharon LeClercq, William St Clair, Andrew B. Nixon, Richard A. Nash, Mark H. Wener, Richard Brasington, Richard M. Silver, Linda M. Griffith, Daniel E. Furst, Ellen Goldmuntz, Keith M. Sullivan

Notice bibliographique

RevueLara D. Veeken · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Sclerosis and Related Diseases
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésMedicinePhenotypeScleroderma (fungus)ImmunologyLymphocyte subsetsSystemic sclerodermaLymphocytePathologyImmune systemDermatomyositisT cellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The Scleroderma: Cyclophosphamide or Transplantation (SCOT) trial compared hematopoietic stem cell transplant to CYC treatment in patients with early SSc with progressive skin and lung or kidney involvement. Here we describe lymphocyte phenotype abnormalities at study entry and the relation to prior DMARD therapy. METHODS: Lymphocyte subsets (n = 26) measured by flow cytometry were compared in 123 heathy controls and 71 SCOT participants, including those given (n = 57) or not given (n = 14) DMARDs within 12 months of randomization. RESULTS: Compared with healthy controls, individuals with SSc showed significant reductions in central memory CD8 T cells, activated total and CD4 T cells, γ/δ T cells, memory B cells, myeloid and plasmacytoid dendritic cells and FOXP3+CD25+ Treg cells and increases in naïve CD4 T cells, effector memory CD4 T cells and effector CD8 T cells. A greater bias towards a IL-4+ Th2/T cytotoxic 2 (Tc2) phenotype based on the Th2:Th1 CD4 ratio and Tc2:Tc1 CD8 T cells was also found. Notably, no difference in any lymphocyte subset was observed between those given or not given prior DMARDs. CONCLUSIONS: In patients with early, severe SSc, significant lymphocyte subset abnormalities were observed. Prior treatment with immunosuppressive therapy did not impact the immunophenotype, suggesting that lymphocyte disturbances in scleroderma appeared to be due to the disease itself. TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov (https://clinicaltrials.gov), NCT00114530.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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