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Enregistrement W4211003614 · doi:10.1101/2022.02.09.22270754

Glycomic Analysis Identifies Pre-Vaccination Markers of Response to Influenza Vaccine, Implicating the Complement Pathway

2022· preprint· en· W4211003614 sur OpenAlexaff
Rui Qin, Guanmin Meng, Smruti Pushalkar, Michael A. Carlock, Ted M. Ross, Christine Vogel, Lara K. Mahal

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVaccinationGlycosylationImmunologyInfluenza vaccineImmune systemGlycanBiologyAntigenAntibodyVirologyGlycoproteinMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Response to vaccination can vary significantly from person to person. A key to improving vaccine design and vaccination strategy is to understand the mechanism behind this variation. The role of glycosylation, a critical modulator of immunity, is unknown in determining vaccine responses. To gain insight into the association between glycosylation and vaccine-induced antibody levels we profiled the pre- and post-vaccination serum protein glycomes of 160 Caucasian adults receiving the FLUZONE™ influenza vaccine during the 2019-2020 influenza season. Using lectin microarrays, we observed that pre-vaccination levels of Lewis A antigen (Le a ) are significantly higher in people who did not mount significant antibody responses, when compared to responders. Glycoproteomic analysis showed that Le a -bearing proteins are enriched in complement activation pathways, suggesting a potential role of glycosylation in tuning the activities of complement proteins, which may be implicated in mounting vaccine responses. We also observed post-vaccination increases in sialyl Lewis X antigen (sLe x ) and decreases in high mannose glycans among high responders, which were not observed in non-responders. This data suggests that the immune system may actively modulate glycosylation as part of its effort to establish effective protection post-vaccination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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