Monocyte Gene and Molecular Expression Profiles Suggest Distinct Effector and Regulatory Functions in Beninese HIV Highly Exposed Seronegative Female Commercial Sex Workers
Notice bibliographique
Résumé
We have previously reported that the female genital tract (FGT) of Beninese HIV highly-exposed seronegative (HESN) commercial sex workers (CSWs), presented elevated frequencies of a myeloid HLA-DR+CD14+CD11c+ population presenting "tolerogenic" monocyte derived dendritic cells (MoDC) features. In order to assess whether a differential profile of monocytes may be involved in the generation of these genital MoDCs, we have herein characterized the blood monocyte compartment of Beninese HESNs (HIV-uninfected ≥ 10 years CSWs) and relevant controls (HIV-uninfected 2.5-5 years CSWs herein termed "early HESNs"), HIV-infected CSWs, and low-risk HIV-uninfected women from the general population. Transcriptomic analyses by RNA-Seq of total sorted blood monocytes demonstrate that in comparison to the control groups, HESNs present increased expression levels of FCGR2C, FCAR, ITGAX, ITGAM, CR2, CD68, and CD163 genes, associated with effector functions. Moreover, we found increased expression levels of genes associated with protection/control against SHIV/HIV such as CCL3, CCL4, CCL5, BHLHE40, and TNFSF13, as well as with immune regulation such as IL-10, Ahr, CD83, and the orphan nuclear receptor (NR)4A1, NR4A2, and NR4A3. Through multicolor flow cytometry analyses, we noticed that the frequencies of intermediate and non-classical monocyte populations tended to be elevated in the blood of HESNs, and exhibited increased expression levels of effector CD16, CD11c, CD11b, as well as regulatory HLA-G, IL-10, and IFN-α markers when compared to HIV-uninfected women and/or HIV-infected CSWs. This profile is compatible with that previously reported in the FGT of HESNs, and likely confers an enormous advantage in their resistance to HIV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».