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Enregistrement W4211120128 · doi:10.1128/9781555816841.ch9

Osmotic Stress

2014· book-chapter· en· W4211120128 sur OpenAlexaff
Janet M. Wood

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsmoregulationOsmotic shockOsmotic pressureBiologyOsmotic concentrationMechanosensitive channelsBiochemistryTranscription (linguistics)Cell biologyGeneSalinityIon channelEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osmotic stress tolerance mechanisms determine whether bacteria survive or grow because osmotic stress profoundly affects the structure, physics, and chemistry of bacterial cells. In vitro studies have shown that K+ glutamate differentially modulates transcription mediated by the σ70 and σS RNA polymerases of Escherichia coli, the latter being central to many stress response. Progress toward understanding the structural changes associated with the opening of representative channels is discussed in this chapter. The study of osmoregulatory proteins is motivated partly by a desire to understand how cells sense osmotic pressure (osmosensing). During the last decade, representative osmoregulatory transporters and mechanosensitive (MS) channels have been shown to both sense osmotic pressure changes (osmosensing) and respond by modulating transmembrane solute distribution (osmoregulation) after purification and reconstitution in proteoliposomes. The osmoregulation of protein activity is discussed by focusing on representative proteins that have been studied. In many bacteria, the proportion of anionic phospholipids increases and the fatty acid composition changes with cultivation at high salinity. For E. coli, growth at high osmolality increases the proportion of CL at the expense of PE without changing the proportion of PG or the fatty acid composition. Interest in the osmoregulation of transcription was stimulated by a desire to understand how osmolality can direct gene expression. Studies focused on promoter identification and the identification of transcriptional regulatory proteins were complicated by multiple factors, including transcription that depends on multiple promoters and σ factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,165

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0490,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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