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Enregistrement W4211265371 · doi:10.1002/alz.12607

Protein phosphatase 2A and complement component 4 are linked to the protective effect of <i>APOE</i> ɛ2 for Alzheimer's disease

2022· article· en· W4211265371 sur OpenAlexfundno aff
Gyungah Jun, Yang You, Congcong Zhu, Gaoyuan Meng, Jaeyoon Chung, Rebecca Panitch, Junming Hu, Weiming Xia, David A. Bennett, Tatiana Foroud, Weixin Wang, Jonathan L. Haines, Richard Mayeux, Margaret A. Pericak‐Vance, Gerard D. Schellenberg, Rhoda Au, Kathryn L. Lunetta, Tsuneya Ikezu, Thor D. Stein, Lindsay A. Farrer

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthNorthwestern UniversityYork UniversityNational Human Genome Research InstituteDuke UniversityWellcome TrustSchool of Medicine, Indiana UniversityJohns Hopkins UniversityNational Institute of Mental HealthBoston UniversityIndiana UniversityOregon Health and Science UniversityNational Cancer InstituteEmory UniversityRush UniversityU.S. Department of Veterans AffairsNew York UniversityMassachusetts General HospitalNational Institute on AgingColumbia UniversityAlzheimer's AssociationMayo ClinicHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésApolipoprotein EProtein phosphatase 2AlleleProtein subunitBiologyComplement systemInduced pluripotent stem cellTau proteinAlzheimer's diseaseSingle-nucleotide polymorphismC4AMolecular biologyGeneGeneticsDiseaseGenotypeInternal medicineMedicineImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction The apolipoprotein E ( APOE ) ɛ2 allele reduces risk against Alzheimer's disease (AD) but mechanisms underlying this effect are largely unknown. Methods We conducted a genome‐wide association study for AD among 2096 ɛ2 carriers. The potential role of the top‐ranked gene and complement 4 (C4) proteins, which were previously linked to AD in ɛ2 carriers, was investigated using human isogenic APOE allele‐specific induced pluripotent stem cell (iPSC)–derived neurons and astrocytes and in 224 neuropathologically examined human brains. Results PPP2CB rs117296832 was the second most significantly associated single nucleotide polymorphism among ɛ2 carriers ( P = 1.1 × 10 −7 ) and the AD risk allele increased PPP2CB expression in blood ( P = 6.6 × 10 −27 ). PPP2CB expression was correlated with phosphorylated tau231/total tau ratio ( P = .01) and expression of C4 protein subunits C4A/B ( P = 2.0 × 10 −4 ) in the iPSCs. PPP2CB (subunit of protein phosphatase 2A) and C4b protein levels were correlated in brain ( P = 3.3 × 10 −7 ). Discussion PP2A may be linked to classical complement activation leading to AD‐related tau pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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