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Enregistrement W4212795244 · doi:10.1093/jcag/gwab049.034

A35 DNA HYPOMETHYLATION INHIBITS TUFT CELL-DERIVED COLITIS-ASSOCIATED CANCER

2022· article· en· W4212795244 sur OpenAlexaffabout
Finn Ole Larsen, Hayley Good, Alice E. Shin, L Zhang, Samuel Asfaha

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerDNA methylationCarcinogenesisColitisCancer researchEpigeneticsAdenomatous polyposis coliCancerBiologySulindacFamilial adenomatous polyposisMolecular biologyImmunologyGene expressionPharmacologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Colorectal cancer is the second leading cause of cancer death in Canada. A major risk factor for the development of colorectal cancer is chronic inflammation leading to colitis-associated cancer (CAC). We previously described a CAC mouse mode in which tumors arise from DCLK1+ tuft cells following loss of the tumor suppressor adenomatous polyposis coli (APC) and induction of colitis. Interestingly, both colitis and CAC display epigenetic changes that modulate gene expression. Specifically, DNA methylation is altered in colitis, but its role in colonic tumorigenesis is not known. We hypothesize that inhibition of DNA methylation in DCLK1+ tuft cells reduces colonic tumorigenesis. Aims In this study, we aim to investigate the role of DNA methylation in CAC by inhibiting DNA methylation by genetic and pharmacologic means. Methods We crossed our Dclk1-CreERT2/Apcf/f mice to DNMT1f/f mice to delete the DNA methyltransferase DNMT1 in DCLK1+ tuft cells. We induced CAC in Dclk1/Apcf/f and Dclk1/Apcf/f/DNMT1f/f mice by administering three doses of tamoxifen followed by 2.5% dextran sodium sulfate (DSS) for five days. Fourteen weeks later we assessed colonic tumor number and size. Lineage tracing of Dclk1+ cells was also examined in colonic tissues from all mice. In a separate cohort of Dclk1/Apcf/f mice, we induced colitis and treated the mice with six doses of the DNA de-methylating drug 5-AZA-2’-deoxycytidine (5-AZA) or vehicle. Ki67 immunostaining was additionally performed to assess cellular proliferation in the colon. Results Deletion of DNMT1 in DCLK1+ cells significantly inhibited the number and size of colonic tumors. Treatment of mice with 5-AZA similarly reduced the overall number of mice with tumors, as well as, the number and size of tumors per mouse. Interestingly, 5-AZA treatment was associated with reduced colonic proliferation as assessed by fewer Ki67+ cells, and quiescent DCLK1+ cells that did not lineage trace. Furthermore, deletion of DNMT1 or treatment with 5-AZA reduced the number of lineage tracing events detected upon exposure to low DSS. Conclusions Our findings demonstrate that loss of Dnmt1 or 5-AZA treatment reduces CAC formation. Furthermore, 5-AZA appears to exert its anti-tumor effects by reducing proliferation and preventing tuft cell stemness. Our data demonstrates that altering DNA methylation plays an important role in CAC. Funding Agencies CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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