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Enregistrement W4212958917 · doi:10.1101/2022.02.06.479326

A transcytotic actin shift polarizes vesicle trajectories and partitions apicobasal epithelial membrane domains

2022· preprint· en· W4212958917 sur OpenAlexfundno aff
Gholamali Jafari, Liakot A. Khan, Hongjie Zhang, Edward Membreno, Siyang Yan, Verena Göbel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsSchool of Medicine, Emory UniversityNational Institutes of HealthBoston Area Diabetes Endocrinology Research CenterMcGill UniversityUniversity of RochesterMedical Center, University of RochesterEmory UniversityUniversity of California, San DiegoMassachusetts General Hospital
Mots-clésPolarity (international relations)Cell polarityVesicleEpithelial polarityMembraneActinDirectionalityApical membraneCell biologyCytoplasmBiologyBiophysicsBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In prevailing epithelial polarity models, membrane-based polarity cues such as the partitioning-defective PARs specify the positions and identities of apicobasal membrane domains. Recent findings suggest, however, that vesicle-associated polarity cues specify membrane polarity by positioning the apical domain, upstream of membrane-based polarity cues. These findings raised the question how vesicles acquire apicobasal directionality independent of polarized target membrane domains. Here, we show that the apical directionality of vesicle trajectories depends on intracellular actin dynamics during the establishment of membrane polarity in the C. elegans intestine. We find that actin, powered by branched-chain actin dynamics, determines the position of apical membrane components, PARs, and itself on expanding membranes. Using photomodulation, we demonstrate that F-actin travels through the cytoplasm and along the cortex towards the future apical domain. Our findings suggest an alternative polarity model where actin-dependent directional trafficking inserts the nascent apical domain into the growing membrane to partition its apicobasal domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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