Molecular phylogenetics reveals the common species of<i>Trochus</i>(Vetigastropoda: Trochidae) found on Japanese temperate subtidal reefs
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Five species of the marine gastropod genus Trochus are found on the Japanese coast. It was considered that Trochus rota was the most northerly species, whereas subtropical species, including T. histrio, were limited to the southern region. In recent years, however, several researchers have reported shells of T. histrio at higher latitudes than the previously assumed northern limit of this species. For the identification of the Japanese Trochus species, traditional shell morphological characters are insufficient. To provide better identification criteria, we performed a detailed morphological investigation and molecular analysis for Trochus individuals (n = 55) collected from a subtidal reef in Nagai, on the temperate Pacific coast of Japan. Our phylogenetic analysis, which was based on the mitochondrial DNA genes cytochrome c oxidase subunit I and 16S ribosomal RNA, shows that T. histrio, despite its relatively low genetic diversity, exhibits substantial variation in the morphology of the shell base (i.e. in the extent of red spotting on the inner part of the aperture and in the prominence of the knobs protruding along the base of the shell periphery). A shell size comparison indicates that the variation in the shell base reflects growth-associated morphological change. We found significant differences between T. histrio and T. rota in two shell characters (the number of knobs along the base of the shell periphery and shell height/width ratio) with size as a covariate. We conclude that these two species can usually be distinguished from each other by the combination of two characters: presence/absence of red spots on the inner aperture and the extent (i.e. number and prominence) of knob-like structures on the shell base. In addition, field sampling in Nagai shows that T. histrio is currently much more common than T. rota at two sites having contrasting kelp forest conditions. The diagnostic criteria presented here provide a useful basis for research on the ecology of Japanese Trochus species.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».