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Enregistrement W4213044796 · doi:10.1093/botlinnean/boab086

Phylogenomic analysis of<i>Tibouchina s.s.</i>(Melastomataceae) highlights the evolutionary complexity of Neotropical savannas

2021· article· en· W4213044796 sur OpenAlexaff
Johanna R. Jantzen, Paulo José Fernandes Guimarães, Leandro Cardoso Pederneiras, Ana Luiza Freitas Oliveira, Pamela S. Soltis

Notice bibliographique

RevueBotanical Journal of the Linnean Society · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesInternational Association for Plant TaxonomySociety for the Study of EvolutionBotanical Society of AmericaFlorida Museum of Natural HistoryAmerican Philosophical Society
Mots-clésMelastomataceaeBiologyPolyphylyCladeEcologyThreatened speciesPhylogenetic treeEvolutionary biologyBiodiversityMonophylyHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The origin of the high biodiversity in the Neotropics remains an unresolved but critical question, especially for the species-rich but understudied savannas of Brazil, such as the campos rupestres and Cerrado. To address this knowledge gap, we leveraged Tibouchina s.s., a clade of flowering plants in Melastomataceae found in the Cerrado and campos rupestres, to uncover the processes that generated the hyper-diverse flora of Neotropical savannas. We used a phylogenomic approach combined with ecological niche modelling and biogeographic analysis to infer the evolutionary processes that have influenced the diversification of Tibouchina s.s. We identified the importance of multiple interacting evolutionary forces, including geographical and ecological divergence, polyploidy and hybridization, and found that Tibouchina s.s. harbours greater diversity than once thought due to polyphyletic species, polyploid species and previously undocumented species. Taken together, these findings support a complex evolutionary history for Tibouchina and underscore the need for continued efforts to generate thoroughly sampled, robust phylogenetic trees for additional plant clades of these threatened Neotropical savannas and for intensive collecting and taxonomic work in these highly diverse but neglected regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,870
Score d'incertitude au seuil0,229

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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