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Enregistrement W4213064266 · doi:10.14785/lymphosign-2021-0029

Case report of a novel mutation in Bruton’s tyrosine kinase gene with confirmed agammaglobulinemia and absent B lymphocytes

2022· article· en· W4213064266 sur OpenAlexvenueno aff
Nouf Bedaiwy, Shatha Alhamdi, Wafaa Al Suwairi, Mohammad Alsalamah

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBruton's tyrosine kinaseX-linked agammaglobulinemiaImmunologyMedicineImmune systemAntibodyGene mutationBronchiectasisMutationTyrosine kinaseBiologyGeneGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: X-linked agammaglobulinemia type 1 (XLA) is one of the most common pediatric inborn errors of immunity affecting the humoral immune system. The condition is caused by a mutation in the Bruton’s tyrosine kinase gene (BTK), located in the long arm of the X-chromosome. BTK is crucial for B lymphocyte differentiation and activation. Therefore, a defect in BTK results in B lymphocyte maturation arrest, absence of plasma cells, and failure of immunoglobulin production. XLA affected individuals present with a history of frequent severe pyogenic infections such as pneumonia, conjunctivitis, otitis media, and bacteremia. Laboratory evaluation classically reveals undetectable immunoglobulins and the absence of B cells. The mainstay treatment is immunoglobulin replacement which can be administered intravenously (IVIG) or subcutaneously (SCIG). Aggressive antimicrobial treatment is also administered to reduce complications such as bronchiectasis or invasive bacterial infections during active infections. Aim: To report the clinical presentation, immune features, and genetic mutation in a case of a four-year-old boy with a novel mutation in the BTK gene leading to XLA. Results: The patient’s chart was reviewed. We describe the phenotypical and diagnostic characteristics of an established case in a four-year-old boy who suffered from recurrent infections. Genetic analysis revealed a pathogenic novel mutation in the BTK gene (c.1953C>A; p.Tyr651*), while flow cytometry found 0% CD19+ (B cells), and low serum Ig levels. Discussion: We report the clinical presentation, immune features, and genetic mutation in a patient with a novel mutation in the BTK gene causing XLA. Genetic analysis along with patient history, physical examination, and laboratory results are necessary to identify and diagnose XLA associated with pathogenic mutations in the BTK gene. Statement of novelty: We present an established case of a novel mutation in the BTK gene (c.1953C>A; p.Tyr651*), based on genetic analysis, absent CD19+cells (B cells), and low Ig serum levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,002
Études des sciences et des technologies0,0040,003
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0070,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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