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In vitro antifungal activity of essential oils against fluconazole-susceptible and-resistant Candida albicans

2018· preprint· en· W4213071474 sur OpenAlexaboutno aff
Farzad Katiraee

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFluconazoleCandida albicansAntifungalMicrobiologyIn vitroChemistryBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical significance and species limits in the genus ArthrodermaIvana Mu00edkovu00e11, Adu00e9la u010cmokovu00e11,2, Connie F.C. Gibas3, Lynne Sigler4, Jeffrey M. Lorch5, Rahul Sharma6, Vu00edt Hubka1,2 1Department of Botany, Faculty of Science, Charles University in Prague, Benu00e1tsku00e1 2, 128 01 Prague 2, Czech Republic2Laboratory of Fungal Genetics and Metabolism, Institute of Microbiology ASCR, Vu00eddeu0148sku00e1 1083, 142 20 Prague 4, Czech Republic3Department of Pathology, University of Texas Health Science Centre, San Antonio, USA4University of Alberta, Microfungus Collection and Herbarium [now UAMH Centre for Global Microfungal Diversity] and Biological Sciences, Edmonton, Alberta, Canada5Molecular and Environmental Toxicology Center, University of Wisconsin at Madison, Medical Sciences Center, 1300 University Avenue, Madison, Wisconsin 53706, USA6Microbial Culture Collection, National Centre for Cell Science, Pune, IndiaObjectives: Geophilic dermatophytes are a speciose ecological group within Arthrodermataceae naturally occurring in soil, especially around burrows and nests of terrestrial vertebrates and birds. They act as relatively uncommon causal agents of infections in human and animals (1u20135 % of all dermatophytoses worlwide) without significant contagious potential. The taxonomy of geophilic dermatophytes has been insufficiently studied compared to their better known relatives from among anthropophilic and zoophilic species. Consequently, significant number of species still await discovery. The aim of this study was to revise species boundaries in the geophilic genus Arthroderma with focus on species occurring in clinical samples.Methods: The examined Arthroderma strains from clinical samples and environment were analysed using DNA sequence data (ITS rDNA region, u03b2-tubulin and translation elongation factor 1-u03b1 genes) and by means of morphological and physiological methods. The agreement between phylogenetic/morphological and biological species concept was studies by using in vitro mating experiments. The morphology of ascospores was examined by scanning electron microscopy and viability of ascospores was determined by flow cytometry.Results: The phylogenetic analysis showed that clinical isolates from the former Trichophyton terrestre complex cluster predominantly in A. quadrifidum, A. insingulare and A. onychocola. In addition, this complex harbours several undescribed soil-borne and cave-dwelling species supported by phylogenetic analysis, mating experiment data and morphology. A neotype designation is needed for Trichophyton terrestre together with name combination in the genus Arthroderma.Conclusions: Several undescribed species were revealed by using multidisciplinary approach in the former Trichophyton terrestre complex. At least three members of this complex are either uncommon agents of infections in human or occur as contaminants in clinical material.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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