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Enregistrement W4213153033 · doi:10.1093/jcag/gwab049.227

A228 A FERMENTABLE FIBRE FREE DIET ACCELERATES SPONTANEOUS COLITIS DEVELOPMENT AND ALTERS THE GUT MICROBIOME IN MUC2-/- MICE

2022· article· en· W4213153033 sur OpenAlexaff
Genelle R. Healey, Alana Schick, Kevan Jacobson, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMucusInulinColitisFirmicutesMicrobiomeMucinMicrobiologyBiologyDysbiosisCecumGut floraBacteriaShort-chain fatty acidFecesFermentationInternal medicineGastroenterologyFood scienceMedicineImmunologyBiochemistryBioinformatics16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background A key feature of ulcerative colitis (UC) is a defective colonic mucus layer. As Muc2-/- mice lack intestinal mucus, they’re often used to model UC. In these mice, luminal bacteria translocate from the gut lumen, triggering spontaneous colitis by 12–16 weeks of age. Notably, mucus defects are also seen in wildtype mice fed a fermentable fibre free (FF-free) diet. Aside from thinner mucus, FF-free fed mice show increased susceptibility to bacterial infections and a microbiome shift from fibre-utilizing to mucus-degrading bacteria. Indeed, a recent clinical study found that a microbiome shift towards proteolytic bacteria preceded clinical diagnosis of UC Aims To determine whether feeding newly weaned Muc2-/- mice a FF-free versus chow or inulin-enriched diet leads to - more rapid development of spontaneous colitis - shifts in the gut microbiota towards protein fermentation Methods Newly weaned Muc2-/- mice (3–4 weeks old) were fed 1 of 3 diets: 1) usual chow (Chow; 14.7% fibre mix), 2) FF-free (10% cellulose – poorly fermented) and 3) inulin-enriched (IN; same nutritional content as FF-free, with 10% inulin instead of cellulose). Body weight, diet intake and disease activity were monitored daily. By day 10, mice in the FF-free group developed severe colitis requiring euthanization. At this time, cecal contents (short-chain fatty acid [SCFA] analysis) and colonic tissue from all mice were collected for alcian blue/PAS staining and histopathological scoring. Stool was collected for 16S rRNA sequencing Results FF-free fed mice consumed fewer calories (p=0.0073), experienced less body weight gain (p=0.002), had colonic shortening (p<0.0001) and higher disease activity scores (p<0.0001) than mice fed the IN diet. Histopathological scores were higher in FF-free versus Chow (p<0.0001) and IN (p<0.0001) fed mice. Goblet cell mucin staining was reduced in FF-free compared to Chow and IN fed mice. Beta-diversity analysis showed clear differences in microbiome composition between groups. Acetate, product of fibre fermentation, was higher in the Chow (p<0.0001) and IN (p=0.0195) groups whereas branched-chain fatty acids (BCFA), product of protein fermentation, was higher in the FF-free group (p<0.0001) Conclusions Spontaneous colitis development in FF-free fed Muc2-/- mice was observed within 10 days (5–6 weeks old) of weaning whereas Chow or IN fed mice showed minimal to no signs of colitis, respectively. A diet devoid of fibre also led to less mucin staining and a gut microbiome shift that favoured BCFA over SCFA production, suggesting the microbiota of FF-free fed Muc2-/- mice are targeting mucosal proteins concurrent with disease exacerbation. These findings support future studies examining whether consumption of low fibre diets in UC patients worsen disease outcomes whereas diets rich in fibre and/or inulin prove beneficial Funding Agencies CCC, CIHRMSFHR Trainee Award, CH.I.L.D foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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