MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4213248386 · doi:10.1186/s40463-022-00558-w

Introduction and expression of <i>PIK3CA</i><sup>E545K</sup> in a papillary thyroid cancer <i>BRAF</i><sup>V600E</sup> cell line leads to a dedifferentiated aggressive phenotype

2022· article· en· W4213248386 sur OpenAlexafffund
Nicole Pinto, Kara M. Ruicci, Mohammed Imran Khan, Mushfiq Hassan Shaikh, Yu Fan Peter Zeng, John Yoo, Kevin Fung, S. Danielle MacNeil, Adrian Mendez, Joe S. Mymryk, John W. Barrett, Paul C. Boutros, Anthony C. Nichols

Notice bibliographique

RevueJournal of Otolaryngology - Head and Neck Surgery · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesInstitute of Cancer ResearchNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésPhenotypePapillary thyroid cancerExpression (computer science)Cancer researchThyroid cancerCancerBiologyMedicineGeneticsGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anaplastic thyroid cancer (ATC) is a rare, aggressive form of undifferentiated thyroid cancer, which exhibits rapid progression and is almost universally fatal. At least a subset of ATC is thought to arise from pre-existing well-differentiated thyroid cancer, most frequently papillary thyroid cancer (PTC). While PIK3CA mutations are rare in PTC, they are common in ATC and tend to co-occur with BRAF mutations. This provided the rationale for our study to identify the potential role of PIK3CA mutations in the progression from well-differentiated to undifferentiated thyroid cancer. We introduced PIK3CA E545K into the LAM1 PTC cell line, which carries a BRAF V600E mutation. In culture, the engineered cell line (LAM1: PIK3CA E545K ) proliferated faster and demonstrated increased clonogenic potential relative to the parental line carrying an empty vector (LAM1 EV ). Both the LAM1 EV and LAM1: PIK3CA E545K edited lines were implanted into hind flanks of athymic nude mice for in vivo determination of disease progression. While tumour weights and volumes were not significantly higher in LAM1: PIK3CA E545K mice, there was a decrease in expression of thyroid differentiation markers TTF-1, thyroglobulin, PAX8 and B-catenin, suggesting that introduction of PIK3CA E545K led to dedifferentiation in vivo. Collectively, this study provides evidence of a role for PIK3CA E545K in driving disease progression from a well-differentiated to an undifferentiated thyroid cancer; however, over-expression was not a determinant of an accelerated growth phenotype in ATC. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,301
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Otolaryngology - Head and Neck SurgeryMême sujetCancer-related Molecular PathwaysTravaux en français237 207