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Enregistrement W4214500137 · doi:10.1093/hmg/ddac050

Multi-ancestry genome-wide association study of gestational diabetes mellitus highlights genetic links with type 2 diabetes

2022· review· en· W4214500137 sur OpenAlexafffund
Natalia Pervjakova, Gunn-Helen Moen, Maria Carolina Borges, Teresa Ferreira, James P. Cook, Catherine Allard, Robin N. Beaumont, Mickaël Canouil, Gad Hatem, Anni Heiskala, Anni Joensuu, Ville Karhunen, Soo Heon Kwak, Frederick T. J. Lin, Jun Liu, Sheryl L. Rifas‐Shiman, Claudia H.T. Tam, Wing Hung Tam, Guðmar Þorleifsson, Toby Andrew, Juha Auvinen, Bishwajit Bhowmik, Amélie Bonnefond, Fabien Delahaye, Ayşe Demirkan, Philippe Froguel, Kadri Haller‐Kikkatalo, Hildur Harðardóttir, Sandra Hummel, Akhtar Hussain, Eero Kajantie, Elina Keikkala, Amna Khamis, Jari Lahti, Tove Lekva, Sanna Mustaniemi, Christine Sommer, Aili Tagoma, Evangelia Tzala, Raivo Uibo, Marja Vääräsmäki, Pia Villa, Kåre I. Birkeland, Luigi Bouchard, Cornelia M. van Duijn, Sarah Finer, Leif Groop, Esa Hämäläinen, Geoffrey Hayes, G. A. Hitman, Hak Chul Jang, Marjo‐Riitta Järvelin, Anne Karen Jenum, Hannele Laivuori, Ronald C.W., Olle Melander, Emily Oken, Kyong Soo Park, Patrice Perron, Rashmi B. Prasad, Elisabeth Qvigstad, Sylvain Sebért, Kāri Stefánsson, Valgerður Steinthórsdóttir, Marie‐France Hivert, Paul W. Franks, Mark I. McCarthy, Cecilia M. Lindgren, Rachel M. Freathy, Andrew P. Morris, Reedik Mägi

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGestational Diabetes Research and Management
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanOntario GenomicsCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCHIST-ERAVetenskapsrådetHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthConseil Régional Hauts-de-FranceNovo Nordisk FondenSigrid Juséliuksen SäätiöEuropean Genomic Institute for DiabetesNorges ForskningsrådAstraZenecaEuropean CommissionSocialdepartementetCentre for Medical Systems BiologyNovo NordiskJuho Vainion SäätiöKorea Health Industry Development InstituteSuomen Lääketieteen SäätiöDiabetesforbundetUniversity of ExeterNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekShanghai Jiao Tong UniversityPäivikki ja Sakari Sohlbergin SäätiöEesti TeadusagentuurEuropean Regional Development FundTerveyden ja hyvinvoinnin laitosAcademy of FinlandUniversity of BristolZonMwBritish Heart FoundationImpact FundFondation Francophone pour la Recherche sur le DiabèteCroucher FoundationTartu ÜlikoolMedical Research CouncilEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöDiabète QuébecOulun YliopistoJoint Programming Initiative A healthy diet for a healthy lifeLastentautien TutkimussäätiöNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research Center OuluAgence Nationale de la RechercheWellcome TrustAmerican Diabetes AssociationJane ja Aatos Erkon SäätiöYrjö Jahnssonin SäätiöHelsingin YliopistoChinese University of Hong KongEli Lilly and Company
Mots-clésGestational diabetesGenome-wide association studyBiologyMendelian randomizationType 2 diabetesTCF7L2Genetic associationGeneticsBioinformaticsPregnancyDiabetes mellitusEndocrinologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGestationGeneGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gestational diabetes mellitus (GDM) is associated with increased risk of pregnancy complications and adverse perinatal outcomes. GDM often reoccurs and is associated with increased risk of subsequent diagnosis of type 2 diabetes (T2D). To improve our understanding of the aetiological factors and molecular processes driving the occurrence of GDM, including the extent to which these overlap with T2D pathophysiology, the GENetics of Diabetes In Pregnancy Consortium assembled genome-wide association studies of diverse ancestry in a total of 5485 women with GDM and 347 856 without GDM. Through multi-ancestry meta-analysis, we identified five loci with genome-wide significant association (P < 5 × 10-8) with GDM, mapping to/near MTNR1B (P = 4.3 × 10-54), TCF7L2 (P = 4.0 × 10-16), CDKAL1 (P = 1.6 × 10-14), CDKN2A-CDKN2B (P = 4.1 × 10-9) and HKDC1 (P = 2.9 × 10-8). Multiple lines of evidence pointed to the shared pathophysiology of GDM and T2D: (i) four of the five GDM loci (not HKDC1) have been previously reported at genome-wide significance for T2D; (ii) significant enrichment for associations with GDM at previously reported T2D loci; (iii) strong genetic correlation between GDM and T2D and (iv) enrichment of GDM associations mapping to genomic annotations in diabetes-relevant tissues and transcription factor binding sites. Mendelian randomization analyses demonstrated significant causal association (5% false discovery rate) of higher body mass index on increased GDM risk. Our results provide support for the hypothesis that GDM and T2D are part of the same underlying pathology but that, as exemplified by the HKDC1 locus, there are genetic determinants of GDM that are specific to glucose regulation in pregnancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,812
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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