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Enregistrement W4214572776 · doi:10.1101/2022.02.25.482019

DLK-dependent biphasic reactivation of herpes simplex virus latency established in the absence of antivirals

2022· preprint· en· W4214572776 sur OpenAlexfundno aff
Sara A. Dochnal, Husain Y. Merchant, Austin R. Schinlever, Aleksandra Babnis, Daniel P. Depledge, Angus C. Wilson, Anna R. Cliffe

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthYork UniversityOwens Family FoundationDeutsches Zentrum für InfektionsforschungUniversity of Pennsylvania
Mots-clésHerpes simplex virusLytic cycleBiologyVirologyViral replicationVirusLatent VirusVirus latencyHistoneDemethylaseGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Understanding the molecular mechanism of herpes simplex virus type 1 (HSV-1) latent infection and reactivation in neurons requires the use of model systems. However, establishing a quiescent infection in cultured neurons is problematic as infectious virus released from any productively infected neuron can superinfect the cultures. Here, we describe a new reporter virus, HSV-1 Stayput-GFP, that is defective for cell-to-cell spread and can be used to model latency and reactivation at the single neuron level. Importantly, quiescent infection of neurons with Stayput-GFP can be established without the use of a viral DNA replication inhibitor. The establishment of a quiescent state requires a longer time frame than previous models of HSV latency using DNA replication inhibitors. This results in a decreased ability of the virus to reactivate, and the use of multiple reactivation triggers is required. Using this system, we demonstrate that an initial Phase I wave of lytic gene expression occurs independently of histone demethylase activity and viral DNA replication but is dependent on the neuronal cell stress protein, DLK. Progression into the later, Phase II wave of reactivation, characterized by detectable late viral protein synthesis and a requirement for histone demethylase activity, is also observed with the Stayput-GFP model system. These data demonstrate that the two waves of viral gene expression following HSV-1 reactivation are independent of secondary infection and occur when latent infections are established in the absence of a viral DNA replication inhibitor. Importance Herpes simplex virus-1 (HSV-1) enters a latent infection in neurons and periodically reactivates. Reactivation manifests as a variety of clinical symptoms. Studying latency and reactivation in vitro is invaluable, allowing the molecular mechanisms behind both processes to be targeted by therapeutics that reduce the clinical consequences. Here, we describe a novel in vitro model system using a cell-to-cell spread defective HSV-1, known as Stayput-GFP, which allows for the study of latency and reactivation at the single neuron level. We anticipate this new model system will be an incredibly valuable tool for studying the establishment and reactivation of HSV-1 latent infection in vitro . Using this model, we find that initial reactivation events are dependent on cellular stress kinase DLK, but independent of histone demethylase activity and viral DNA replication. Our data therefore demonstrate the essential role of DLK in mediating a wave of lytic gene expression unique to reactivation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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