Rap1 regulates TIP60 function during fate transition between two-cell-like and pluripotent states
Notice bibliographique
Résumé
In mammals, the conserved telomere binding protein Rap1 serves a diverse set of nontelomeric functions, including activation of the NF-kB signaling pathway, maintenance of metabolic function in vivo, and transcriptional regulation. Here, we uncover the mechanism by which Rap1 modulates gene expression. Using a separation-of-function allele, we show that Rap1 transcriptional regulation is largely independent of TRF2-mediated binding to telomeres and does not involve direct binding to genomic loci. Instead, Rap1 interacts with the TIP60/p400 complex and modulates its histone acetyltransferase activity. Notably, we show that deletion of Rap1 in mouse embryonic stem cells increases the fraction of two-cell-like cells. Specifically, Rap1 enhances the repressive activity of Tip60/p400 across a subset of two-cell-stage genes, including Zscan4 and the endogenous retrovirus MERVL. Preferential up-regulation of genes proximal to MERVL elements in Rap1-deficient settings implicates these endogenous retroviral elements in the derepression of proximal genes. Altogether, our study reveals an unprecedented link between Rap1 and the TIP60/p400 complex in the regulation of pluripotency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».