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Enregistrement W4214761517 · doi:10.1681/asn.2021050723

DGAT2 Inhibition Potentiates Lipid Droplet Formation To Reduce Cytotoxicity in APOL1 Kidney Risk Variants

2022· article· en· W4214761517 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Institutes of Health
Mots-clésCytotoxicityCytotoxic T cellLipogenesisKidneyLipid dropletRenal injury

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Two variants in the gene encoding apolipoprotein L1 (APOL1) that are highly associated with African ancestry are major contributors to the large racial disparity in rates of human kidney disease. We previously demonstrated that recruitment of APOL1 risk variants G1 and G2 from the endoplasmic reticulum to lipid droplets leads to reduced APOL1-mediated cytotoxicity in human podocytes. Methods We used CRISPR-Cas9 gene editing of induced pluripotent stem cells to develop human-derived APOL1 G0/G0 and APOL1 G2/G2 kidney organoids on an isogenic background, and performed bulk RNA sequencing of organoids before and after treatment with IFN- γ . We examined the number and distribution of lipid droplets in response to treatment with inhibitors of diacylglycerol O-acyltransferases 1 and 2 (DGAT1 and DGAT2) in kidney cells and organoids. Results APOL1 was highly upregulated in response to IFN- γ in human kidney organoids, with greater increases in organoids of high-risk G1 and G2 genotypes compared with wild-type (G0) organoids. RNA sequencing of organoids revealed that high-risk APOL1 G2/G2 organoids exhibited downregulation of a number of genes involved in lipogenesis and lipid droplet biogenesis, as well as upregulation of genes involved in fatty acid oxidation. There were fewer lipid droplets in unstimulated high-risk APOL1 G2/G2 kidney organoids than in wild-type APOL1 G0/G0 organoids. Whereas DGAT1 inhibition reduced kidney organoid lipid droplet number, DGAT2 inhibition unexpectedly increased organoid lipid droplet number. DGAT2 inhibition promoted the recruitment of APOL1 to lipid droplets, with associated reduction in cytotoxicity. Conclusions Lipogenesis and lipid droplet formation are important modulators of APOL1-associated cytotoxicity. Inhibition of DGAT2 may offer a potential therapeutic strategy to attenuate cytotoxic effects of APOL1 risk variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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