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Enregistrement W4214770147 · doi:10.1002/cpt.2563

PharmVar GeneFocus: <i>CYP3A5</i>

2022· review· en· W4214770147 sur OpenAlexafffund
Cristina Rodríguez‐Antona, Jessica Savieo, Volker M. Lauschke, Katrin Sangkuhl, Britt I. Drögemöller, Daqing Wang, Ron H. N. van Schaik, А. А. Гилеп, Arul Prakasam Peter, Erin C. Boone, Bronwyn Ramey-Hartung, Teri E. Klein, Michelle Whirl‐Carrillo, Victoria M. Pratt, Andrea Gaedigk

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2022
Typereview
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of ManitobaResearch Institute in Oncology and HematologyChildren's Hospital Research Institute of ManitobaCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteErzincan ÜniversitesiNational Institutes of HealthVetenskapsrådetOntario Institute for Cancer ResearchNational Institute of General Medical SciencesEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsKungliga Tekniska HögskolanRobert Bosch StiftungMcGill University
Mots-clésPharmacogenomicsCYP3A5PharmacogeneticsAlleleLocus (genetics)TacrolimusBiologyGeneticsComputational biologyMedicineGeneBioinformaticsTransplantationGenotypeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pharmacogene Variation Consortium (PharmVar) catalogs star (*) allele nomenclature for the polymorphic human CYP3A5 gene. Genetic variation within the CYP3A5 gene locus impacts the metabolism of several clinically important drugs, including the immunosuppressants tacrolimus, sirolimus, cyclosporine, and the benzodiazepine midazolam. Variable CYP3A5 activity is of clinical importance regarding tacrolimus metabolism. This GeneFocus provides a CYP3A5 gene summary with a focus on aspects regarding standardized nomenclature. In addition, this review also summarizes recent changes and updates, including the retirement of several allelic variants and provides an overview of how PharmVar CYP3A5 star allele nomenclature is utilized by the Pharmacogenomics Knowledgebase (PharmGKB) and the Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,866
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,004
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0030,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0430,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,624
Tête enseignante GPT0,626
Écart entre enseignants0,002 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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