Bayesian and parsimony phylogeny of Augochlora bees (Hymenoptera: Apoidea) based on morphology: insights for their biogeography and natural history
Notice bibliographique
Résumé
AugochloraSmith, with 127 valid species, is the most widespread genus of Augochlorini bees, ranging from Argentina to southern Canada, including the Caribbean islands. The genus is divided into three subgenera,Augochloras. str.,OxystoglossellaEickwort, and the fossilElectraugochloraEngel. The extant subgenera were traditionally diagnosed by their nesting substrate, social behavior and morphology. However, accumulating evidence suggests that these features are not reliable for their separation, especially with the discovery of an enigmatic species sharing characteristics from both subgenera. Our objective is to provide a phylogenetic hypothesis to evaluate the monophyly of the extant subgenera and to place a new species, Augochlora (Augochlora) intermedia sp. nov. For this purpose, we compiled 110 unordered characters for 40 species ofAugochloraplus seven outgroup species and analyzed under parsimony and Bayesian inference. Topologies were very similar under both frameworks, allowing us to consistently characterize a few major lineages. Our results demonstrate that the extant subgenera correspond to monophyletic groups and the new species is sister group to remainingAugochloras. str. species. Both subgenera are widespread in the Western Hemisphere, with species groups differing in range and distributional patterns. Our interpretation is thatAugochloraarose in South America, subsequently colonizing Mesoamerica, the Caribbean and North America several times. Facultative social behavior can be found in both subgenera and in most lineages, indicating that the exclusive solitary behavior found inAugochlora purais an exception. Based on morphological clues we interpret that the habit of nesting out of the soil arose once inAugochloras. str.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».