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Enregistrement W4214920207 · doi:10.3389/ffunb.2022.805127

Multiple Fungi May Connect the Roots of an Orchid (Cypripedium reginae) and Ash (Fraxinus nigra) in Western Newfoundland

2022· article· en· W4214920207 sur OpenAlexafffundabout
Nimalka Weerasuriya, Katarina Kukolj, R. R. Spencer, Dmitry Sveshnikov, R. Greg Thorn

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Fungal Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandWestern University
Organismes subventionnairesMemorial University of Newfoundland
Mots-clésBiologyBotanyPlant use of endophytic fungi in defenseFraxinusOrchidaceaeEndophyteInternal transcribed spacerRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Showy lady's slipper ( Cypripedium reginae Walter, Orchidaceae) and black ash ( Fraxinus nigra Marshall, Oleaceae) often co-occur in close proximity in fens in western Newfoundland, Canada. Metabarcoding of DNA extracted from root samples of both species following surface sterilization, and others without surface sterilization was used to determine if there were shared fungal endophytes in the roots of both species that could form a common mycorrhizal network between them. A wide variety of fungi were recovered from primers amplifying the nuclear ribosomal internal transcribed spacer region (ITS2). Sixty-six fungal sequences were shared by surface-sterilized roots of both orchid and ash, among them arbuscular mycorrhizal fungi ( Claroideoglomus, Dominikia, Glomus and Rhizophagus ), ectomycorrhizal fungi ( Inocybe and Tomentella ), the broad-host root endophyte Cadophora orchidicola , along with root pathogens ( Dactylonectria, Ilyonectria, Pyricularia , and Xylomyces ) and fungi of unknown function. There appear to be multiple fungi that could form a common mycorrhizal network between C. reginae and F. nigra , which might explain their frequent co-occurrence. Transfer of nutrients or carbon between the orchid and ash via one or more of the shared fungal endophytes remains to be demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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